111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4593 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4593  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 
206 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1943  nitrogen-fixing NifU-like  48.91 
 
 
191 aa  132  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2142  nitrogen-fixing NifU-like protein  44.68 
 
 
294 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2188  NifU domain-containing protein  44.68 
 
 
294 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2129  NifU domain-containing protein  45.39 
 
 
294 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0750308  normal  0.014165 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2542  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.51 
 
 
306 aa  95.1  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2413  NifU domain-containing protein  44.52 
 
 
297 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0708227  normal  0.256977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  34.55 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3815  hypothetical protein  40.97 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473897  normal  0.0339082 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08130  hypothetical protein  37.36 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2624  hypothetical protein  41.76 
 
 
412 aa  72.8  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.541634 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.78 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.22 
 
 
285 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  36.84 
 
 
270 aa  60.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  37.86 
 
 
289 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.78 
 
 
72 aa  58.5  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.45 
 
 
309 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32 
 
 
290 aa  56.6  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  38.64 
 
 
311 aa  55.8  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.19 
 
 
86 aa  55.1  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.84 
 
 
86 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.16 
 
 
87 aa  53.5  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.71 
 
 
73 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.85 
 
 
73 aa  53.9  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  30.19 
 
 
289 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1525  HesB/YadR/YfhF-family protein  35.29 
 
 
195 aa  52  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  38.89 
 
 
72 aa  51.2  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4600  nitrogen-fixing NifU-like  33.9 
 
 
158 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357598  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.43 
 
 
301 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  32.43 
 
 
296 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.89 
 
 
74 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.36 
 
 
289 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.36 
 
 
289 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  43.06 
 
 
84 aa  49.3  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40630  hypothetical protein  34.12 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  38.03 
 
 
75 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3445  hypothetical protein  34.12 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  41.67 
 
 
86 aa  48.9  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213209  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.36 
 
 
77 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.33 
 
 
79 aa  48.9  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  34.29 
 
 
81 aa  48.5  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  32.18 
 
 
326 aa  48.1  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  39.71 
 
 
73 aa  48.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0419  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.28 
 
 
86 aa  48.1  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.21 
 
 
73 aa  48.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  40.28 
 
 
89 aa  47.8  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.39 
 
 
76 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  38.89 
 
 
74 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  38.67 
 
 
103 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3360  nitrogen-fixing NifU-like  30.2 
 
 
173 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.595792  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  35.62 
 
 
75 aa  46.2  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  33.33 
 
 
78 aa  46.6  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1109  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.67 
 
 
88 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.88 
 
 
79 aa  45.8  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2358  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.5 
 
 
86 aa  45.4  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  32.39 
 
 
79 aa  45.4  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28760  NfuA protein  32.56 
 
 
194 aa  45.4  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  34.29 
 
 
72 aa  45.1  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2344  HesB/YadR/YfhF-family protein  31.4 
 
 
193 aa  45.1  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0112883 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  30 
 
 
81 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  31.82 
 
 
333 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.86 
 
 
79 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.86 
 
 
79 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  30.67 
 
 
191 aa  44.7  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  31.94 
 
 
78 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  31.94 
 
 
78 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  31.94 
 
 
78 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  31.94 
 
 
78 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  31.94 
 
 
78 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0484  yhgI protein  28.24 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.508791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  31.94 
 
 
78 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  31.94 
 
 
78 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  31.94 
 
 
78 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  31.94 
 
 
78 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  31.94 
 
 
78 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1723  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.33 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  30 
 
 
81 aa  43.5  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  31.43 
 
 
81 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0925  hypothetical protein  36.23 
 
 
86 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0198354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  32.86 
 
 
81 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  33.33 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1782  NifU family protein  36.76 
 
 
88 aa  43.9  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  28.57 
 
 
81 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.98 
 
 
78 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.39 
 
 
73 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  23.21 
 
 
186 aa  43.1  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  35.21 
 
 
73 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.29 
 
 
78 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4936  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.35 
 
 
85 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336138  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0047  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.73 
 
 
81 aa  43.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  30 
 
 
81 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1326  NifU domain-containing protein  30.14 
 
 
79 aa  42.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  30.99 
 
 
81 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  30 
 
 
76 aa  42.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  30 
 
 
81 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  30 
 
 
81 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  30.99 
 
 
81 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  30 
 
 
81 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  35.21 
 
 
74 aa  42.4  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.73 
 
 
74 aa  42.4  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>