267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0260 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  100 
 
 		 74 aa  151  2.9999999999999998e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  56.16 
 
 		 73 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.7 
 
 		 73 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.05 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  54.05 
 
 		 76 aa  77.8  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  54.93 
 
 		 73 aa  77.8  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.7 
 
 		 73 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.43 
 
 		 200 aa  73.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.11 
 
 		 72 aa  72.8  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  50 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  50.68 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2861  nitrogen-fixing NifU-like protein  42.25 
 
 		 80 aa  71.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  48.65 
 
 		 74 aa  71.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.59 
 
 		 77 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  50 
 
 		 72 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  50.72 
 
 		 254 aa  71.2  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  45.95 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.95 
 
 		 74 aa  70.1  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.95 
 
 		 73 aa  70.1  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1070  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.59 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.57 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  44.59 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  47.14 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  45.95 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.48 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  45.95 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  45.95 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  45.95 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  45.95 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  45.95 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  45.95 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  45.95 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  45.95 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  45.95 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  47.3 
 
 		 74 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  47.54 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  44.59 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  52.94 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  47.3 
 
 		 72 aa  67  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.24 
 
 		 74 aa  67  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.67 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  46.48 
 
 		 74 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.24 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.48 
 
 		 73 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.07 
 
 		 73 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  40 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  46.48 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  43.66 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  45.21 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  46.48 
 
 		 74 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  45.07 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.25 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  46.48 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  40.62 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.67 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.67 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.25 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  47.89 
 
 		 73 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  43.84 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  43.24 
 
 		 80 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  43.24 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  43.24 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  45.07 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  42.47 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  45.07 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  45.31 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  39.44 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  39.73 
 
 		 187 aa  62  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  41.33 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  40.28 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  39.73 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  39.44 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00755  NifU protein, putative  39.44 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0945933  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  39.44 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  40.85 
 
 		 192 aa  60.8  0.000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.48 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  39.44 
 
 		 190 aa  60.8  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  39.44 
 
 		 190 aa  60.8  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  41.1 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  39.44 
 
 		 213 aa  60.8  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  41.1 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  41.1 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  41.1 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4477  HesB/YadR/YfhF  36.71 
 
 		 206 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0747916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  46.27 
 
 		 75 aa  60.1  0.000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  40.28 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  43.06 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  40 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  40.28 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  36.99 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  40.28 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.94 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  40.28 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  40.28 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  37.84 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  42.19 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.84 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2324  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.19 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.575512  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  35.62 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.48 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>