244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0047 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0047  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 81 aa  164  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1109  nitrogen-fixing NifU domain protein  60 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0925  hypothetical protein  59.46 
 
 		 86 aa  95.5  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0198354 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2324  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.05 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.575512  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  55.41 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4936  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.67 
 
 		 85 aa  86.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  57.53 
 
 		 86 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2358  nitrogen-fixing NifU domain protein  57.53 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  56.16 
 
 		 89 aa  85.9  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0419  nitrogen-fixing NifU domain protein  56.16 
 
 		 86 aa  85.5  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  54.79 
 
 		 86 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213209  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.42 
 
 		 86 aa  84.3  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.32 
 
 		 73 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  48.65 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.95 
 
 		 77 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.05 
 
 		 73 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.68 
 
 		 73 aa  77  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.3 
 
 		 74 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  47.3 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  47.3 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  47.3 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  47.3 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  47.3 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  47.3 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  47.3 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  47.3 
 
 		 78 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  47.3 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  47.3 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  47.3 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  47.3 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.68 
 
 		 73 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  47.95 
 
 		 73 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  45.95 
 
 		 74 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.61 
 
 		 76 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.43 
 
 		 81 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.19 
 
 		 79 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  43.84 
 
 		 73 aa  72  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  49.3 
 
 		 81 aa  71.6  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  44.59 
 
 		 74 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  48.57 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  45.71 
 
 		 74 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.85 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  48.53 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00755  NifU protein, putative  45.71 
 
 		 80 aa  68.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0945933  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  40 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  46.38 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  42.47 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  46.38 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  40.54 
 
 		 80 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  40.54 
 
 		 80 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  47.06 
 
 		 81 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  47.06 
 
 		 81 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  47.06 
 
 		 81 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  40.54 
 
 		 80 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  46.05 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.37 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.37 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  47.06 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  45.21 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  45.21 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.1 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.54 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.54 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.86 
 
 		 73 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  44.74 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1326  NifU domain-containing protein  45.71 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.93 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.93 
 
 		 289 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  47.95 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  45.83 
 
 		 80 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.84 
 
 		 72 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  43.84 
 
 		 72 aa  64.7  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.24 
 
 		 74 aa  64.3  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  45.21 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3360  nitrogen-fixing NifU-like  41.1 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.595792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46593  predicted protein  45.21 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.78436  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.19 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2673  HesB/YadR/YfhF-family protein  42.47 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114695 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  39.44 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.84 
 
 		 290 aa  61.6  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  48.65 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4600  nitrogen-fixing NifU-like  40.54 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.89 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  39.19 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  38.89 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.67 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01524  protein GntY  38.36 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  38.89 
 
 		 311 aa  57  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  36.49 
 
 		 270 aa  57  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  40.79 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  39.19 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  40 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  41.27 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  40.54 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9865  predicted protein  48.21 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.07223  normal  0.100166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2542  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.36 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.08 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0163  putative DNA uptake protein  39.44 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3750  putative DNA uptake protein  39.44 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>