265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01524 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01524  protein GntY  100 
 
 		 199 aa  406  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2673  HesB/YadR/YfhF-family protein  84.42 
 
 		 199 aa  345  3e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114695 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2084  HesB/YadR/YfhF-family protein  81.12 
 
 		 199 aa  329  1e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.92431  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2172  thioredoxin-like protein  81.12 
 
 		 199 aa  329  2e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03266  predicted gluconate transport associated protein  43.75 
 
 		 191 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00179798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0299  IscR-regulated protein YhgI  43.75 
 
 		 191 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044435  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3889  putative DNA uptake protein  43.75 
 
 		 191 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3695  putative DNA uptake protein  43.75 
 
 		 191 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4721  putative DNA uptake protein  43.75 
 
 		 191 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03218  hypothetical protein  43.75 
 
 		 191 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00164281  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3611  putative DNA uptake protein  43.75 
 
 		 191 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3795  putative DNA uptake protein  43.75 
 
 		 191 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0299  putative DNA uptake protein  43.75 
 
 		 191 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00815707  normal  0.0446785 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3827  putative DNA uptake protein  42.71 
 
 		 191 aa  173  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3710  putative DNA uptake protein  43.23 
 
 		 191 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.238496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3785  putative DNA uptake protein  43.23 
 
 		 191 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3713  putative DNA uptake protein  43.23 
 
 		 191 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3881  putative DNA uptake protein  43.23 
 
 		 191 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3819  putative DNA uptake protein  43.23 
 
 		 191 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4233  putative DNA uptake protein  43.52 
 
 		 192 aa  170  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3750  putative DNA uptake protein  42.19 
 
 		 191 aa  169  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0163  putative DNA uptake protein  42.19 
 
 		 191 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1525  HesB/YadR/YfhF-family protein  43.23 
 
 		 195 aa  169  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3990  putative DNA uptake protein  42.19 
 
 		 191 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3926  putative DNA uptake protein  41.67 
 
 		 191 aa  168  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2009  hypothetical protein  40.31 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40630  hypothetical protein  41.88 
 
 		 194 aa  168  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3445  hypothetical protein  41.88 
 
 		 194 aa  168  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0316  putative DNA uptake protein  40.62 
 
 		 191 aa  167  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4119  putative DNA uptake protein  41.67 
 
 		 191 aa  167  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0159  putative DNA uptake protein  44.04 
 
 		 192 aa  167  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4634  putative DNA uptake protein  41.15 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03996  putative DNA uptake protein  42.49 
 
 		 192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001879  NfuA Fe-S protein maturation  43.23 
 
 		 194 aa  165  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0234  putative DNA uptake protein  40.62 
 
 		 191 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4010  putative DNA uptake protein  41.97 
 
 		 192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00614  putative DNA uptake protein  42.19 
 
 		 194 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3502  putative DNA uptake protein  43.52 
 
 		 192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.840353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3794  putative DNA uptake protein  41.97 
 
 		 192 aa  162  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100459  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3880  putative DNA uptake protein  41.97 
 
 		 192 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4619  putative DNA uptake protein  42.49 
 
 		 192 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28760  NfuA protein  41.36 
 
 		 194 aa  161  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3528  putative DNA uptake protein  43.01 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0142  putative DNA uptake protein  41.97 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4324  putative DNA uptake protein  41.97 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4125  putative DNA uptake protein  41.97 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3804  putative DNA uptake protein  41.97 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.472358 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4003  putative DNA uptake protein  41.97 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.860921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4192  putative DNA uptake protein  41.97 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2344  HesB/YadR/YfhF-family protein  40.1 
 
 		 193 aa  159  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0112883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0179  putative DNA uptake protein  41.45 
 
 		 192 aa  158  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0106  putative DNA uptake protein  41.45 
 
 		 192 aa  158  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.790621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2293  putative DNA uptake protein  41.15 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0244  putative DNA uptake protein  40.93 
 
 		 192 aa  155  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1491  putative DNA uptake protein  38.54 
 
 		 193 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241637  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2911  putative DNA uptake protein  38.02 
 
 		 194 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3202  putative DNA uptake protein  38.86 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0161749 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1888  HesB/YadR/YfhF  38.22 
 
 		 196 aa  151  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0220  putative DNA uptake protein  40.93 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.722098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2378  yhgI protein  42.93 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0102502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3317  HesB/YadR/YfhF-family protein  42.93 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0770851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1985  IscR-regulated protein YhgI  42.93 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.858904  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1891  IscR-regulated protein YhgI  42.93 
 
 		 194 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2161  HesB/YadR/YfhF-family protein  40.84 
 
 		 194 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.0420771 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1847  HesB/YadR/YfhF-family protein  38.97 
 
 		 216 aa  141  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000308783 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2202  HesB/YadR/YfhF  38.46 
 
 		 257 aa  140  9e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.20209  decreased coverage  0.00866489 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1911  hypothetical protein  37.95 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000392795  hitchhiker  0.00108913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3104  HesB/YadR/YfhF  40.84 
 
 		 194 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2457  HesB/YadR/YfhF-family protein  36.98 
 
 		 211 aa  131  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0172331  normal  0.307716 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2735  yhgI protein  40.72 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2466  HesB/YadR/YfhF:nitrogen-fixing NifU, C-terminal  40.21 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0790017  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0484  yhgI protein  34.59 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.508791  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1723  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.54 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  46.97 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  47.06 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.89 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.12 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  40 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.65 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  45.59 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  45.59 
 
 		 74 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0047  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.36 
 
 		 81 aa  57.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.54 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  42.65 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.76 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  30.43 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.04 
 
 		 286 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  41.67 
 
 		 74 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.28 
 
 		 285 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  40 
 
 		 76 aa  53.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  41.33 
 
 		 78 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  31.48 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  39.74 
 
 		 80 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  45.07 
 
 		 72 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  39.74 
 
 		 80 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  40.26 
 
 		 80 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  44.64 
 
 		 75 aa  52.8  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  32.89 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  30.56 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.43 
 
 		 73 aa  52  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>