251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3360 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3360  nitrogen-fixing NifU-like  100 
 
 
173 aa  351  2.9999999999999997e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.595792  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  71.43 
 
 
289 aa  238  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  70.81 
 
 
289 aa  237  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  67.25 
 
 
309 aa  233  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4600  nitrogen-fixing NifU-like  64.52 
 
 
158 aa  204  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357598  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  55.7 
 
 
270 aa  183  8e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.79 
 
 
301 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  43.31 
 
 
289 aa  142  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  44.59 
 
 
296 aa  141  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.31 
 
 
290 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  35.06 
 
 
291 aa  93.2  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  38.69 
 
 
311 aa  84.3  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  55.13 
 
 
86 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.56 
 
 
86 aa  82  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.4 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  52.56 
 
 
84 aa  78.2  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2358  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.56 
 
 
86 aa  77  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  52.56 
 
 
86 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213209  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  52.56 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.43 
 
 
87 aa  76.6  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0419  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.28 
 
 
86 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  45.71 
 
 
73 aa  75.5  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  48.57 
 
 
74 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  50 
 
 
74 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00755  NifU protein, putative  48.53 
 
 
80 aa  72.8  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0945933  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.3 
 
 
74 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  29.75 
 
 
289 aa  72  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.85 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2129  NifU domain-containing protein  37.9 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0750308  normal  0.014165 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  47.83 
 
 
73 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2142  nitrogen-fixing NifU-like protein  37.9 
 
 
294 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2188  NifU domain-containing protein  37.9 
 
 
294 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226918 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.83 
 
 
73 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.83 
 
 
73 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3815  hypothetical protein  32.69 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473897  normal  0.0339082 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 
73 aa  69.7  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.14 
 
 
73 aa  68.6  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  47.76 
 
 
74 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.06 
 
 
79 aa  68.2  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2542  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.43 
 
 
306 aa  67.8  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  49.21 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.27 
 
 
73 aa  67.4  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.57 
 
 
77 aa  67.4  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2324  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.55 
 
 
96 aa  67.4  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.575512  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.47 
 
 
79 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0925  hypothetical protein  42.25 
 
 
86 aa  66.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0198354 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1109  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.1 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.45 
 
 
81 aa  64.3  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.86 
 
 
72 aa  64.3  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0047  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.1 
 
 
81 aa  63.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.47 
 
 
81 aa  63.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  46.38 
 
 
80 aa  63.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  43.48 
 
 
81 aa  63.2  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  46.38 
 
 
81 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  42.03 
 
 
81 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  46.38 
 
 
81 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  46.38 
 
 
81 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  43.48 
 
 
81 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  46.38 
 
 
81 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  40.85 
 
 
74 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  42.03 
 
 
81 aa  62.4  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.86 
 
 
73 aa  62  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1326  NifU domain-containing protein  43.94 
 
 
79 aa  62  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  40.58 
 
 
81 aa  61.6  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  40.58 
 
 
81 aa  61.6  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  40 
 
 
76 aa  61.6  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  45.71 
 
 
213 aa  61.6  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.79 
 
 
74 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.47 
 
 
183 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.58 
 
 
76 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4936  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.44 
 
 
85 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336138  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  40 
 
 
76 aa  60.1  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  42.03 
 
 
75 aa  59.3  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  40 
 
 
72 aa  58.9  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.58 
 
 
79 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.58 
 
 
79 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  42.42 
 
 
76 aa  58.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  42.25 
 
 
75 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  40 
 
 
81 aa  58.2  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0994  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.88 
 
 
78 aa  58.2  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  37.66 
 
 
78 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  37.66 
 
 
78 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  37.66 
 
 
78 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  37.66 
 
 
78 aa  57.4  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  37.66 
 
 
78 aa  57.4  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  37.66 
 
 
78 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  37.66 
 
 
78 aa  57.4  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  37.66 
 
 
78 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  37.66 
 
 
78 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  37.66 
 
 
78 aa  57.4  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  37.66 
 
 
78 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46593  predicted protein  36.73 
 
 
225 aa  57.4  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.78436  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1632  NifU-like protein  44.93 
 
 
72 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000186996  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  41.79 
 
 
72 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1302  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.03 
 
 
84 aa  56.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0063306  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  39.39 
 
 
79 aa  56.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  42.86 
 
 
75 aa  55.5  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.11 
 
 
78 aa  55.5  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  38.33 
 
 
254 aa  55.1  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.35 
 
 
78 aa  54.7  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>