284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0464 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  100 
 
 		 75 aa  149  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  57.53 
 
 		 74 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  58.33 
 
 		 72 aa  85.9  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  59.15 
 
 		 73 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  60.56 
 
 		 74 aa  84  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  59.15 
 
 		 74 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  56.16 
 
 		 74 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.17 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  54.79 
 
 		 73 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  56.34 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  50 
 
 		 81 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  50 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  50 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.93 
 
 		 73 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  50 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  50 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  50 
 
 		 81 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  50 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.52 
 
 		 74 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  50 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.52 
 
 		 73 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  51.39 
 
 		 76 aa  74.7  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.94 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  48.65 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  47.3 
 
 		 81 aa  73.6  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  52.05 
 
 		 75 aa  73.2  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.89 
 
 		 81 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  48.65 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.48 
 
 		 79 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.48 
 
 		 79 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.68 
 
 		 77 aa  72  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2324  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.21 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.575512  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.7 
 
 		 86 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.95 
 
 		 76 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.94 
 
 		 73 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  46.48 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.78 
 
 		 73 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.05 
 
 		 74 aa  70.5  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  50 
 
 		 76 aa  70.5  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  45.07 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.58 
 
 		 73 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  54.84 
 
 		 84 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  56.45 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  43.66 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  45.95 
 
 		 80 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  53.23 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213209  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.32 
 
 		 73 aa  68.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  53.23 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0047  nitrogen-fixing NifU domain protein  40 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0419  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.23 
 
 		 86 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  50 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2358  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.61 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  52.94 
 
 		 74 aa  67.4  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1782  NifU family protein  52.17 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0925  hypothetical protein  42.25 
 
 		 86 aa  66.6  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0198354 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  47.95 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1109  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.86 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.1 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  43.84 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  50 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.58 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  50 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1326  NifU domain-containing protein  41.03 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4936  nitrogen-fixing NifU domain protein  40 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  49.32 
 
 		 190 aa  63.5  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1070  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.48 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  48.39 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  48.39 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  42.67 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  48.39 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  48.39 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.62 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  48.39 
 
 		 187 aa  62  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  43.24 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  53.23 
 
 		 191 aa  62  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  46.67 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  48.39 
 
 		 186 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  46.77 
 
 		 186 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  48 
 
 		 242 aa  60.8  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46593  predicted protein  38.89 
 
 		 225 aa  60.5  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.78436  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  46.77 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  46.77 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  45.16 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  50.85 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  50.85 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  50.85 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  43.55 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  50.85 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  50.85 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  46.77 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  42.25 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  50.85 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  50.82 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  50.85 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  50.85 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3360  nitrogen-fixing NifU-like  42.03 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.595792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.68 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  50.85 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>