More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0889 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 72 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  69.86 
 
 		 73 aa  101  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  69.86 
 
 		 73 aa  97.8  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  69.44 
 
 		 72 aa  97.8  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  69.86 
 
 		 73 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  65.71 
 
 		 73 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  67.12 
 
 		 73 aa  94  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  70.42 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  67.14 
 
 		 76 aa  93.6  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  67.12 
 
 		 74 aa  93.6  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  65.75 
 
 		 74 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  64.29 
 
 		 74 aa  92.8  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  68.49 
 
 		 73 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  65.28 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  66.67 
 
 		 72 aa  91.7  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  67.12 
 
 		 74 aa  90.5  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  60.27 
 
 		 73 aa  90.5  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  68.49 
 
 		 74 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  62.32 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  60.81 
 
 		 74 aa  86.3  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  57.75 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  58.33 
 
 		 75 aa  85.9  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  60.87 
 
 		 78 aa  84  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  60.87 
 
 		 78 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  60.87 
 
 		 78 aa  84  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  60.87 
 
 		 78 aa  84  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  60.87 
 
 		 78 aa  84  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  60.87 
 
 		 78 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  60.87 
 
 		 78 aa  84  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  60.87 
 
 		 78 aa  84  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  60.87 
 
 		 78 aa  84  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  60.87 
 
 		 78 aa  84  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  54.93 
 
 		 81 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  54.93 
 
 		 81 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  54.93 
 
 		 81 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  55.71 
 
 		 81 aa  83.6  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  54.93 
 
 		 81 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  54.29 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  53.52 
 
 		 81 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  60.29 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  58.33 
 
 		 76 aa  83.2  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  60.27 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  54.29 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  53.73 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  55.22 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  54.29 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  53.52 
 
 		 80 aa  81.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  62.86 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  61.43 
 
 		 75 aa  80.9  0.000000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  58.9 
 
 		 73 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.24 
 
 		 76 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.32 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1632  NifU-like protein  70.42 
 
 		 72 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000186996  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.73 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  55.07 
 
 		 80 aa  79.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  52.24 
 
 		 79 aa  80.1  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.73 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  55.07 
 
 		 80 aa  79.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  57.53 
 
 		 75 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  56.52 
 
 		 80 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  52.24 
 
 		 76 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  62.71 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2324  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.42 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.575512  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  61.02 
 
 		 78 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0925  hypothetical protein  53.52 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0198354 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  48.57 
 
 		 213 aa  77.4  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0419  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.32 
 
 		 86 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  58.33 
 
 		 191 aa  77  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  49.32 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213209  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  49.32 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  49.32 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.32 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1514  NifU domain protein  71.83 
 
 		 72 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120627  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.32 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1377  NifU domain-containing protein  70.42 
 
 		 72 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000465416  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  51.39 
 
 		 75 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2358  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.95 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  49.21 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  52.11 
 
 		 74 aa  72.8  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46593  predicted protein  47.06 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.78436  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2861  nitrogen-fixing NifU-like protein  45.95 
 
 		 80 aa  72  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0994  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.17 
 
 		 78 aa  70.9  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.47 
 
 		 309 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.54 
 
 		 198 aa  70.5  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00755  NifU protein, putative  45.07 
 
 		 80 aa  70.5  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0945933  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  43.55 
 
 		 188 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  41.67 
 
 		 289 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  43.55 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  48.33 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  46.67 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  45.61 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  45 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  45 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  45 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1782  NifU family protein  52.94 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  46.67 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4936  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.86 
 
 		 85 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  50 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>