245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0994 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0994  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 78 aa  158  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  55.41 
 
 		 75 aa  90.1  8e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.63 
 
 		 77 aa  87.4  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  48.65 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  53.03 
 
 		 74 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.39 
 
 		 74 aa  79.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  54.55 
 
 		 73 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  53.03 
 
 		 74 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  49.28 
 
 		 73 aa  77.8  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.03 
 
 		 73 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  58.06 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 73 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.86 
 
 		 73 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  41.43 
 
 		 75 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.21 
 
 		 79 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.93 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.17 
 
 		 72 aa  70.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  48.57 
 
 		 72 aa  69.3  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.27 
 
 		 74 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  45.07 
 
 		 74 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.48 
 
 		 73 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.75 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  40.58 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.48 
 
 		 73 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.43 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  43.66 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2324  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.62 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.575512  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1109  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.86 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  50 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  48.44 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  48.44 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  48.44 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  48.44 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  48.44 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  48.44 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  48.44 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  48.44 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  48.44 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4936  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.71 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  48.44 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00755  NifU protein, putative  36.36 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0945933  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0925  hypothetical protein  41.18 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0198354 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  46.48 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  36.23 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213209  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  36.23 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  38.57 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2358  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.23 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2861  nitrogen-fixing NifU-like protein  35.71 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0419  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.78 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  44.44 
 
 		 289 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  34.78 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3360  nitrogen-fixing NifU-like  37.88 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.595792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.72 
 
 		 301 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  40 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  34.72 
 
 		 296 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  44.93 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  44.93 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1632  NifU-like protein  49.28 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000186996  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  43.48 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  37.68 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.24 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.78 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1875  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.62 
 
 		 299 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  38.36 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.62 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.68 
 
 		 286 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  36.84 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.94 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1483  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.21 
 
 		 281 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.530906  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  40 
 
 		 183 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  34.78 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.98 
 
 		 198 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  45 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.76 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  43.33 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3926  putative DNA uptake protein  41.67 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.27 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 		 309 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  40 
 
 		 189 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.33 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  36.99 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.84 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.84 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  40.98 
 
 		 187 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0484  NifU domain-containing protein  40.54 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0047  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.51 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  40.98 
 
 		 184 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  36.99 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  40.98 
 
 		 186 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  36.99 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  40 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  40.98 
 
 		 186 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  39.73 
 
 		 185 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  36.49 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  40.98 
 
 		 187 aa  50.8  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  39.34 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  38.33 
 
 		 190 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1514  NifU domain protein  52.17 
 
 		 72 aa  50.8  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120627  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  40.98 
 
 		 186 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  40.98 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>