268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0365 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  100 
 
 		 191 aa  384  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  55.78 
 
 		 198 aa  204  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.23 
 
 		 183 aa  197  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.09 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.77 
 
 		 200 aa  185  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  46.11 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  45 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  44.44 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  47.25 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  43.33 
 
 		 184 aa  155  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  43.72 
 
 		 189 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  45.11 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  42.78 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  43.78 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  41.99 
 
 		 183 aa  148  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  43.48 
 
 		 189 aa  148  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  45.41 
 
 		 206 aa  147  7e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  42.16 
 
 		 189 aa  144  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  42.25 
 
 		 188 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  42.39 
 
 		 187 aa  144  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  41.57 
 
 		 190 aa  143  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  42.47 
 
 		 299 aa  143  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  43.89 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  40.21 
 
 		 190 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  41.18 
 
 		 188 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  43.33 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  38.12 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  39.27 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  42.55 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  38.74 
 
 		 188 aa  137  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  38.74 
 
 		 188 aa  137  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  42.47 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  39.78 
 
 		 192 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  42.47 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  38.5 
 
 		 305 aa  135  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  39.25 
 
 		 188 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  39.89 
 
 		 186 aa  134  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  39.2 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  42.46 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  38.3 
 
 		 192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  40.22 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  40 
 
 		 191 aa  131  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  39.11 
 
 		 180 aa  131  6.999999999999999e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  37.91 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  41.21 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  38.98 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  40 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  38.64 
 
 		 188 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  38.04 
 
 		 187 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  37.97 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  38.07 
 
 		 186 aa  124  7e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  37.91 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  38.38 
 
 		 188 aa  122  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.728561 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  34.48 
 
 		 326 aa  117  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  35.9 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  35.64 
 
 		 254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1051  scaffold protein Nfu/NifU  38.25 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.906453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  34.95 
 
 		 242 aa  101  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01900  iron ion homeostasis-related protein, putative  34.39 
 
 		 309 aa  93.2  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  30.77 
 
 		 186 aa  84.3  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  26.82 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  58.33 
 
 		 72 aa  77  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2988  nitrogen-fixing NifU domain protein  27.72 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.89 
 
 		 74 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1632  NifU-like protein  59.72 
 
 		 72 aa  70.5  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000186996  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  52.94 
 
 		 81 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  53.12 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  54.69 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  54.69 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  54.69 
 
 		 81 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  53.12 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  54.69 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  54.69 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  46.05 
 
 		 80 aa  68.6  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  55.17 
 
 		 72 aa  68.6  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  49.21 
 
 		 73 aa  68.2  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1514  NifU domain protein  59.72 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120627  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.76 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.76 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  55.07 
 
 		 74 aa  67  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.43 
 
 		 73 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1377  NifU domain-containing protein  58.33 
 
 		 72 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000465416  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.06 
 
 		 73 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.61 
 
 		 77 aa  66.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  44.93 
 
 		 76 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  53.62 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  51.67 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2324  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.39 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.575512  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  46.75 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  51.67 
 
 		 80 aa  65.5  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  51.67 
 
 		 80 aa  65.5  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  51.67 
 
 		 80 aa  65.5  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  51.61 
 
 		 74 aa  65.5  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  50.68 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  51.56 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.67 
 
 		 73 aa  64.7  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  51.56 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>