288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0531 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  100 
 
 		 184 aa  377  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  79.35 
 
 		 186 aa  310  9e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  81.08 
 
 		 187 aa  309  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  78.38 
 
 		 187 aa  300  6.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  77.84 
 
 		 187 aa  294  5e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  78.8 
 
 		 186 aa  292  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  78.8 
 
 		 186 aa  292  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  66.84 
 
 		 201 aa  249  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  65.61 
 
 		 188 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  66.31 
 
 		 186 aa  245  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  63.87 
 
 		 190 aa  244  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  61.98 
 
 		 189 aa  240  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  65.26 
 
 		 189 aa  240  9e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  64.4 
 
 		 190 aa  240  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  64.4 
 
 		 190 aa  240  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  64.17 
 
 		 186 aa  238  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  61.29 
 
 		 188 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  62.03 
 
 		 187 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  59.79 
 
 		 188 aa  232  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  62.3 
 
 		 183 aa  231  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  60.22 
 
 		 188 aa  229  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  61.5 
 
 		 187 aa  228  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  61.54 
 
 		 191 aa  228  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  62.43 
 
 		 192 aa  228  4e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  67.76 
 
 		 185 aa  228  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  60.43 
 
 		 192 aa  227  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  61.11 
 
 		 190 aa  226  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  59.16 
 
 		 190 aa  223  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  63.48 
 
 		 188 aa  221  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  57.53 
 
 		 189 aa  216  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  58.42 
 
 		 188 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  58.42 
 
 		 188 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  63.13 
 
 		 188 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  55.91 
 
 		 187 aa  213  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  61.24 
 
 		 188 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  57.37 
 
 		 188 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  60 
 
 		 187 aa  209  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  56.38 
 
 		 187 aa  209  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  58.51 
 
 		 188 aa  207  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  56.84 
 
 		 195 aa  204  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  54.79 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  50.27 
 
 		 180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  49.44 
 
 		 191 aa  190  1e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1051  scaffold protein Nfu/NifU  55.32 
 
 		 187 aa  184  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.906453  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  46.57 
 
 		 326 aa  176  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  46.49 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  44.68 
 
 		 186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01900  iron ion homeostasis-related protein, putative  51.06 
 
 		 309 aa  169  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.21 
 
 		 183 aa  157  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.98 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  42.55 
 
 		 254 aa  156  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  43.33 
 
 		 191 aa  155  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  45.55 
 
 		 195 aa  154  5.0000000000000005e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.02 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  42.02 
 
 		 242 aa  145  5e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.15 
 
 		 200 aa  131  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  35.96 
 
 		 299 aa  118  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  34.97 
 
 		 305 aa  115  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.28 
 
 		 299 aa  102  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  32.04 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  31.84 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2988  nitrogen-fixing NifU domain protein  26.42 
 
 		 202 aa  80.9  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  46.58 
 
 		 80 aa  74.7  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  45.83 
 
 		 76 aa  72  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  48.53 
 
 		 81 aa  71.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  48.53 
 
 		 81 aa  71.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.89 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  48.53 
 
 		 81 aa  71.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.89 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  48.57 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  46.38 
 
 		 81 aa  70.5  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  45.71 
 
 		 81 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46593  predicted protein  41.49 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.78436  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  45.71 
 
 		 81 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 		 81 aa  70.5  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  45.71 
 
 		 81 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.1 
 
 		 74 aa  69.7  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.24 
 
 		 74 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  46.38 
 
 		 81 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.07 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  46.27 
 
 		 81 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  45.71 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  46.48 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  43.42 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  46.48 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  46.48 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  46.48 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1070  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.24 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  46.48 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  46.48 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  46.48 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  43.42 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  46.48 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  46.48 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  46.48 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  46.48 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0330  nitrogen-fixing NifU-like protein  44.3 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  45.21 
 
 		 80 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  42.86 
 
 		 103 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>