246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3394 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  96.81 
 
 		 188 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  96.81 
 
 		 188 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  82.45 
 
 		 187 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  82.98 
 
 		 188 aa  295  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  80.85 
 
 		 187 aa  291  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  68.25 
 
 		 189 aa  267  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  66.67 
 
 		 188 aa  261  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  66.15 
 
 		 190 aa  259  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  64.36 
 
 		 186 aa  259  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  64.36 
 
 		 186 aa  256  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  63.68 
 
 		 188 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  65.79 
 
 		 188 aa  255  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  64.02 
 
 		 188 aa  254  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  65.1 
 
 		 190 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  65.1 
 
 		 190 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  66.49 
 
 		 189 aa  250  7e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  62.5 
 
 		 192 aa  247  6e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  64.64 
 
 		 190 aa  244  4e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  65.36 
 
 		 188 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  60.32 
 
 		 187 aa  239  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  64.8 
 
 		 188 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  65 
 
 		 188 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  61.75 
 
 		 191 aa  234  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  57.98 
 
 		 187 aa  227  9e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  58.51 
 
 		 187 aa  225  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1051  scaffold protein Nfu/NifU  64.55 
 
 		 187 aa  224  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.906453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  59.04 
 
 		 186 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  58.2 
 
 		 192 aa  217  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  56.38 
 
 		 183 aa  216  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  59.57 
 
 		 186 aa  214  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  57.67 
 
 		 187 aa  214  7e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  55.5 
 
 		 190 aa  212  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  57.37 
 
 		 184 aa  211  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  59.04 
 
 		 185 aa  211  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  59.04 
 
 		 186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  57.07 
 
 		 201 aa  210  9e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  55.32 
 
 		 189 aa  205  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  53.48 
 
 		 191 aa  199  3e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  55.73 
 
 		 195 aa  198  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  53.93 
 
 		 187 aa  197  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  53.4 
 
 		 187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  45.21 
 
 		 186 aa  180  9.000000000000001e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  46.63 
 
 		 206 aa  174  5e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  43.75 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  44.9 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  43.84 
 
 		 326 aa  164  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01900  iron ion homeostasis-related protein, putative  44.21 
 
 		 309 aa  155  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  39.27 
 
 		 254 aa  155  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  42.56 
 
 		 195 aa  148  4e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.47 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  39.27 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  38.02 
 
 		 242 aa  139  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.43 
 
 		 183 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.14 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  40 
 
 		 299 aa  122  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.46 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  36.36 
 
 		 305 aa  112  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.16 
 
 		 299 aa  105  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  30.32 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.68 
 
 		 72 aa  67  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  26.2 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  45.16 
 
 		 80 aa  62  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.36 
 
 		 74 aa  62  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  40.98 
 
 		 80 aa  62  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  45 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.67 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  43.55 
 
 		 80 aa  60.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  37.18 
 
 		 76 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.9 
 
 		 79 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.9 
 
 		 79 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  43.55 
 
 		 80 aa  60.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  40 
 
 		 74 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1070  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.03 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.18 
 
 		 73 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  41.94 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  34.15 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  40 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  38.57 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  40 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2988  nitrogen-fixing NifU domain protein  26.46 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.9 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.84 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.68 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  40.32 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  36.49 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  40.32 
 
 		 78 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  40.32 
 
 		 78 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  40.32 
 
 		 78 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  40.32 
 
 		 78 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  40.32 
 
 		 78 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  40.32 
 
 		 78 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  40.32 
 
 		 78 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0330  nitrogen-fixing NifU-like protein  40.58 
 
 		 91 aa  57.4  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  40.32 
 
 		 78 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  40.32 
 
 		 78 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.98 
 
 		 81 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  40.32 
 
 		 78 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4936  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.16 
 
 		 85 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  35.9 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>