228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0962 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 
81 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  52.05 
 
 
74 aa  79.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.74 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00755  NifU protein, putative  50.75 
 
 
80 aa  72  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0945933  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1483  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.43 
 
 
281 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.530906  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  45.83 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  47.44 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  45.57 
 
 
195 aa  70.5  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  44.44 
 
 
184 aa  70.5  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.89 
 
 
73 aa  70.5  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  42.47 
 
 
188 aa  70.5  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  43.84 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  42.25 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  42.25 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  44.44 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  47.22 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1875  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.43 
 
 
299 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12597  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  43.66 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  43.66 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  42.25 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  44.44 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.52 
 
 
74 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  44.44 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.57 
 
 
87 aa  68.6  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.3 
 
 
198 aa  68.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.42 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  41.1 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  47.62 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  45.07 
 
 
191 aa  67.4  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.89 
 
 
72 aa  67.4  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  45.83 
 
 
190 aa  67.4  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.43 
 
 
73 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.43 
 
 
73 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  41.25 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  49.23 
 
 
74 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.89 
 
 
73 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  40.85 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  47.89 
 
 
73 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  49.3 
 
 
72 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  47.89 
 
 
76 aa  65.5  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  47.14 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1326  NifU domain-containing protein  46.88 
 
 
79 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  41.1 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.21 
 
 
74 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  40.91 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  40 
 
 
79 aa  64.3  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  44.44 
 
 
192 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  47.14 
 
 
74 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.93 
 
 
73 aa  63.9  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  45.12 
 
 
305 aa  63.9  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  50 
 
 
103 aa  63.5  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  39.71 
 
 
188 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  43.66 
 
 
81 aa  63.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  50 
 
 
191 aa  63.5  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  43.66 
 
 
81 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  47.14 
 
 
74 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  46.48 
 
 
75 aa  63.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  42.25 
 
 
189 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  39.71 
 
 
188 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.75 
 
 
79 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.75 
 
 
79 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3360  nitrogen-fixing NifU-like  42.47 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.595792  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  44 
 
 
75 aa  63.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  46.48 
 
 
242 aa  63.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.36 
 
 
309 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.58 
 
 
289 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.67 
 
 
81 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  43.04 
 
 
81 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  41.67 
 
 
186 aa  62.4  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  42.25 
 
 
81 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  39.73 
 
 
186 aa  62.4  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  42.25 
 
 
81 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  42.25 
 
 
81 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  43.04 
 
 
81 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  42.25 
 
 
81 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  46.48 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  46.48 
 
 
72 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  40 
 
 
86 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  49.3 
 
 
254 aa  62  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  47.14 
 
 
73 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  43.94 
 
 
76 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  43.66 
 
 
81 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2358  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.66 
 
 
86 aa  61.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  38.36 
 
 
296 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  38.67 
 
 
188 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.36 
 
 
301 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  40.54 
 
 
80 aa  60.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  54.1 
 
 
74 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.25 
 
 
86 aa  61.2  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4936  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.65 
 
 
85 aa  60.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336138  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.19 
 
 
76 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  44.12 
 
 
81 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.25 
 
 
77 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.44 
 
 
183 aa  60.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  43.06 
 
 
185 aa  60.8  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  38.67 
 
 
187 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  47.89 
 
 
299 aa  60.5  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  42.25 
 
 
195 aa  60.5  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  50.79 
 
 
75 aa  60.5  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.66 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>