193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01075 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  100 
 
 		 305 aa  628  1e-179  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  54.97 
 
 		 299 aa  334  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.17 
 
 		 299 aa  307  1.0000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.21 
 
 		 200 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.29 
 
 		 198 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.81 
 
 		 198 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  38.5 
 
 		 191 aa  135  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.43 
 
 		 183 aa  132  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  39.34 
 
 		 187 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  34.97 
 
 		 190 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  35.48 
 
 		 189 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  36.7 
 
 		 187 aa  123  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  37.16 
 
 		 187 aa  122  9e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  35.52 
 
 		 186 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  34.76 
 
 		 187 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  34.97 
 
 		 184 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  34.69 
 
 		 183 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  35.52 
 
 		 186 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  33.51 
 
 		 188 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  34.17 
 
 		 188 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  34.57 
 
 		 187 aa  112  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  36.36 
 
 		 188 aa  112  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  33.51 
 
 		 187 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  35.29 
 
 		 187 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  35.08 
 
 		 189 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  37.57 
 
 		 188 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  37.57 
 
 		 188 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  35.29 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  32.46 
 
 		 188 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  33.33 
 
 		 192 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  34.01 
 
 		 186 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  35.52 
 
 		 186 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  33.17 
 
 		 188 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  31.69 
 
 		 188 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  32.98 
 
 		 195 aa  108  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  32.79 
 
 		 187 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  36.61 
 
 		 206 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  34.97 
 
 		 186 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  31.84 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  32.84 
 
 		 326 aa  106  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  32.46 
 
 		 189 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  31.55 
 
 		 190 aa  105  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  35.75 
 
 		 190 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  35.75 
 
 		 190 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  30.77 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  34.24 
 
 		 185 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  33.33 
 
 		 191 aa  103  4e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  35.29 
 
 		 188 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  34.92 
 
 		 192 aa  102  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  33.7 
 
 		 254 aa  102  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  30.6 
 
 		 188 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  32.07 
 
 		 188 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  32.24 
 
 		 180 aa  99  8e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  31.38 
 
 		 191 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  33.16 
 
 		 195 aa  97.8  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  35.48 
 
 		 186 aa  91.3  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  35.48 
 
 		 186 aa  90.1  4e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1051  scaffold protein Nfu/NifU  33.33 
 
 		 187 aa  85.1  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.906453  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01900  iron ion homeostasis-related protein, putative  32.43 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  28.57 
 
 		 186 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.22 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.22 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.45 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.97 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.21 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  26.92 
 
 		 186 aa  64.7  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.12 
 
 		 81 aa  63.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.27 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  55.93 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  50 
 
 		 81 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  50 
 
 		 81 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  47.37 
 
 		 81 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  48.68 
 
 		 81 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  49.28 
 
 		 76 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.27 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  50 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  50 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  50 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  50 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  42.35 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.46 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.46 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.97 
 
 		 81 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.11 
 
 		 76 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  40.24 
 
 		 79 aa  57  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  44.62 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  44.74 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.08 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  46.88 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  53.19 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  45.57 
 
 		 81 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.1 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46593  predicted protein  44.78 
 
 		 225 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.78436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  44.44 
 
 		 74 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  45 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.66 
 
 		 73 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_002936  DET1632  NifU-like protein  48.57 
 
 		 72 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000186996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  43.28 
 
 		 78 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.33 
 
 		 280 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  43.28 
 
 		 78 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>