More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1812 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  99.66 
 
 
294 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  100 
 
 
294 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  74.49 
 
 
293 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  65.08 
 
 
296 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  66.45 
 
 
306 aa  413  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  64.24 
 
 
300 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  65.89 
 
 
309 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  64.75 
 
 
291 aa  362  4e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  55 
 
 
284 aa  323  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.67 
 
 
284 aa  321  8e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  54 
 
 
286 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.69 
 
 
277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.74 
 
 
291 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  56.74 
 
 
291 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.11 
 
 
288 aa  301  9e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  54.85 
 
 
285 aa  300  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.25 
 
 
280 aa  298  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.96 
 
 
290 aa  294  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.69 
 
 
283 aa  294  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.33 
 
 
286 aa  291  9e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.76 
 
 
281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.08 
 
 
281 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.25 
 
 
298 aa  282  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.83 
 
 
278 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.72 
 
 
276 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.86 
 
 
329 aa  276  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.13 
 
 
309 aa  276  4e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.99 
 
 
284 aa  272  5.000000000000001e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  50.32 
 
 
312 aa  269  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.64 
 
 
281 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.81 
 
 
277 aa  261  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.5 
 
 
344 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0043  nitrogen fixation protein NifU  36.34 
 
 
330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  37.83 
 
 
338 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  37.46 
 
 
331 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2153  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.78 
 
 
329 aa  191  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1162  acetolactate synthase small subunit  34.78 
 
 
330 aa  189  4e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1771  NifU family protein  34.78 
 
 
330 aa  188  8e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.630256  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2007  nitrogen-fixing NifU-like-like  35.19 
 
 
324 aa  187  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1697  nitrogen fixation protein NifU  34.97 
 
 
333 aa  186  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0518954  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0290  NifU family protein  34.59 
 
 
323 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0264  NifU family protein  34.59 
 
 
323 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0237  NifU family protein  34.59 
 
 
323 aa  182  7e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1487  NifU-like protein  33.85 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  38.12 
 
 
333 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.77 
 
 
328 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2174  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.1 
 
 
203 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2231  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.06 
 
 
203 aa  142  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2001  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.76 
 
 
203 aa  142  6e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.488301 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0236  IscU protein  39.06 
 
 
203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0533  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.76 
 
 
200 aa  139  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0207  IscU protein  37.31 
 
 
203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2362  NifU domain-containing protein  37.5 
 
 
203 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.201706  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0366  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.67 
 
 
203 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.041625  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  45.27 
 
 
150 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.56 
 
 
207 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  52.42 
 
 
149 aa  132  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3998  FeS cluster assembly scaffold IscU  50 
 
 
132 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455021  hitchhiker  0.00958668 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.03 
 
 
145 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.42 
 
 
142 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  52.42 
 
 
144 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  50 
 
 
132 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.79 
 
 
153 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  49.19 
 
 
133 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  49.19 
 
 
133 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1046  FeS cluster assembly scaffold IscU  50 
 
 
128 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  47.41 
 
 
139 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  51.61 
 
 
143 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  50.41 
 
 
143 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.39 
 
 
132 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  52.42 
 
 
144 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1361  FeS cluster assembly scaffold IscU  50 
 
 
142 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.41 
 
 
127 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  48.39 
 
 
128 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  47.58 
 
 
138 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  46.77 
 
 
133 aa  126  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1562  FeS cluster assembly scaffold IscU  49.19 
 
 
137 aa  126  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.43451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  47.58 
 
 
139 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  50.81 
 
 
129 aa  125  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  50.41 
 
 
123 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2289  scaffold protein  47.58 
 
 
133 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0320081  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  45.59 
 
 
135 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1478  scaffold protein  48.8 
 
 
128 aa  124  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.671651  hitchhiker  0.00720513 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  46.77 
 
 
130 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  45.59 
 
 
135 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  47.58 
 
 
138 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  49.19 
 
 
124 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  47.58 
 
 
182 aa  123  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  47.58 
 
 
137 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1657  scaffold protein  48.8 
 
 
128 aa  124  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.269786  hitchhiker  0.00054209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  45.26 
 
 
135 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  47.58 
 
 
135 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  49.19 
 
 
128 aa  123  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  48.39 
 
 
125 aa  123  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1951  scaffold protein  46.77 
 
 
127 aa  122  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468917  normal  0.344726 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  50 
 
 
122 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2204  scaffold protein  46.77 
 
 
127 aa  122  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00285299  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  46.77 
 
 
135 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  49.19 
 
 
133 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1026  scaffold protein  46.77 
 
 
133 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00834233  normal  0.269597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>