More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0101 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  100 
 
 		 283 aa  577  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  64.06 
 
 		 280 aa  358  4e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  63.7 
 
 		 281 aa  358  8e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  62.63 
 
 		 278 aa  355  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  65.36 
 
 		 281 aa  332  4e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.4 
 
 		 284 aa  311  9e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.4 
 
 		 284 aa  311  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.87 
 
 		 281 aa  310  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.08 
 
 		 286 aa  308  8e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.67 
 
 		 276 aa  296  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.93 
 
 		 277 aa  295  4e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.68 
 
 		 296 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  54.86 
 
 		 285 aa  288  7e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.24 
 
 		 290 aa  288  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.67 
 
 		 286 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.5 
 
 		 309 aa  285  5.999999999999999e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.4 
 
 		 300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.11 
 
 		 284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.24 
 
 		 288 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.69 
 
 		 294 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.35 
 
 		 294 aa  276  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.65 
 
 		 291 aa  275  5e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  51.65 
 
 		 291 aa  275  5e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.77 
 
 		 306 aa  275  9e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.99 
 
 		 293 aa  271  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.37 
 
 		 277 aa  261  6.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  44.9 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.97 
 
 		 309 aa  257  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.55 
 
 		 298 aa  256  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.29 
 
 		 291 aa  251  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.2 
 
 		 329 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.44 
 
 		 344 aa  235  6e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1697  nitrogen fixation protein NifU  36.45 
 
 		 333 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0518954  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1162  acetolactate synthase small subunit  35.09 
 
 		 330 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0043  nitrogen fixation protein NifU  35.31 
 
 		 330 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  32.43 
 
 		 338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0290  NifU family protein  34.62 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0264  NifU family protein  34.62 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0237  NifU family protein  34.62 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  34.46 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1487  NifU-like protein  33.97 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2153  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.59 
 
 		 329 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1771  NifU family protein  35.42 
 
 		 330 aa  159  5e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.630256  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.92 
 
 		 328 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2007  nitrogen-fixing NifU-like-like  32.05 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  56.59 
 
 		 173 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2174  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.27 
 
 		 203 aa  147  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2231  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.1 
 
 		 203 aa  146  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2001  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.74 
 
 		 203 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.488301 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0207  IscU protein  40.96 
 
 		 203 aa  145  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  53.33 
 
 		 127 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.7 
 
 		 150 aa  144  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  56.41 
 
 		 149 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  55.56 
 
 		 143 aa  143  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2362  NifU domain-containing protein  39.68 
 
 		 203 aa  143  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.201706  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0533  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.3 
 
 		 200 aa  142  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.14 
 
 		 146 aa  142  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.42 
 
 		 137 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0366  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.68 
 
 		 203 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.041625  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.89 
 
 		 154 aa  140  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  33.23 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.7 
 
 		 145 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  54.7 
 
 		 122 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  53.85 
 
 		 144 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0236  IscU protein  39.58 
 
 		 203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  51.28 
 
 		 125 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.99 
 
 		 142 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  52.99 
 
 		 144 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.14 
 
 		 124 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  53.39 
 
 		 129 aa  136  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 207 aa  136  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  52.5 
 
 		 211 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.99 
 
 		 138 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.14 
 
 		 137 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  52.5 
 
 		 133 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  51.28 
 
 		 124 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.18 
 
 		 153 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  50 
 
 		 123 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  53.33 
 
 		 127 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  48.72 
 
 		 131 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  53.33 
 
 		 127 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1294  scaffold protein  53.33 
 
 		 127 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691863  normal  0.0125117 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  51.28 
 
 		 143 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  50.83 
 
 		 130 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  50.83 
 
 		 139 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2265  scaffold protein  53.33 
 
 		 127 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1459  scaffold protein  53.33 
 
 		 127 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0275409  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1740  scaffold protein  53.33 
 
 		 127 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1820  scaffold protein  53.33 
 
 		 127 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00411311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2279  scaffold protein  53.33 
 
 		 127 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0078288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2148  scaffold protein  52.5 
 
 		 127 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245787  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  56.31 
 
 		 153 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1962  scaffold protein  52.5 
 
 		 127 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0186056  hitchhiker  0.00197009 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2501  scaffold protein  52.5 
 
 		 127 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0368834  normal  0.021811 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2385  scaffold protein  52.5 
 
 		 127 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000223926  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  45 
 
 		 129 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2396  scaffold protein  52.5 
 
 		 127 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2423  scaffold protein  50.83 
 
 		 127 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  49.17 
 
 		 128 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  49.17 
 
 		 128 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>