288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0463 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  100 
 
 		 188 aa  387  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  81.48 
 
 		 189 aa  324  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  86.59 
 
 		 188 aa  320  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  85.96 
 
 		 188 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  79.78 
 
 		 188 aa  291  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  75.14 
 
 		 191 aa  284  5.999999999999999e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  73.89 
 
 		 190 aa  277  7e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  68.42 
 
 		 190 aa  275  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  65.95 
 
 		 188 aa  272  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  67.02 
 
 		 186 aa  271  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  65.41 
 
 		 188 aa  270  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  67.89 
 
 		 189 aa  267  5.9999999999999995e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  64.55 
 
 		 188 aa  265  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  66.84 
 
 		 190 aa  259  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  66.84 
 
 		 190 aa  259  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  63.68 
 
 		 188 aa  257  8e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  63.68 
 
 		 188 aa  257  8e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  64.89 
 
 		 186 aa  256  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  63.68 
 
 		 188 aa  256  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  61.58 
 
 		 192 aa  254  7e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  63.49 
 
 		 187 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  61.38 
 
 		 187 aa  249  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  62.63 
 
 		 187 aa  248  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  65.61 
 
 		 184 aa  246  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  64.02 
 
 		 187 aa  245  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  65.26 
 
 		 188 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  59.79 
 
 		 186 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  60.32 
 
 		 187 aa  234  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  60 
 
 		 187 aa  230  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  59.79 
 
 		 186 aa  228  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  58.2 
 
 		 201 aa  227  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  59.79 
 
 		 186 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1051  scaffold protein Nfu/NifU  61.17 
 
 		 187 aa  224  6e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.906453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  55.03 
 
 		 183 aa  218  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  55.79 
 
 		 190 aa  217  7e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  61.9 
 
 		 185 aa  216  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  58.73 
 
 		 192 aa  216  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  57.89 
 
 		 195 aa  205  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  52.36 
 
 		 187 aa  197  7e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  52.66 
 
 		 189 aa  196  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  49.46 
 
 		 191 aa  187  9e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  51.56 
 
 		 187 aa  185  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  49.73 
 
 		 206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  47.09 
 
 		 180 aa  181  4.0000000000000006e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01900  iron ion homeostasis-related protein, putative  50.79 
 
 		 309 aa  177  5.999999999999999e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  47.09 
 
 		 186 aa  176  3e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  46.46 
 
 		 326 aa  171  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  48.15 
 
 		 186 aa  166  1e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  41.45 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  43.01 
 
 		 242 aa  153  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  42.35 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.22 
 
 		 183 aa  142  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.13 
 
 		 198 aa  141  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  39.25 
 
 		 191 aa  135  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  38.55 
 
 		 299 aa  122  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.63 
 
 		 198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.42 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  32.46 
 
 		 305 aa  110  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.73 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  30.56 
 
 		 186 aa  87.8  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2988  nitrogen-fixing NifU domain protein  26.02 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  42.53 
 
 		 80 aa  70.5  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  42.53 
 
 		 80 aa  70.5  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  42.53 
 
 		 80 aa  70.1  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.88 
 
 		 74 aa  67.8  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  26.52 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  46.77 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.33 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  45.16 
 
 		 78 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  45.16 
 
 		 78 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  45.16 
 
 		 78 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  45.16 
 
 		 78 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.03 
 
 		 74 aa  63.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  45.16 
 
 		 78 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  45.16 
 
 		 78 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  45.16 
 
 		 78 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  45.16 
 
 		 78 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  45.16 
 
 		 78 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  40.54 
 
 		 80 aa  64.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  45.16 
 
 		 78 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.66 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  49.18 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.66 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  37.5 
 
 		 103 aa  62  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.26 
 
 		 77 aa  62  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  36.99 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  48.33 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.44 
 
 		 81 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1782  NifU family protein  36 
 
 		 88 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  47.76 
 
 		 74 aa  60.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0330  nitrogen-fixing NifU-like protein  41.54 
 
 		 91 aa  60.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.37 
 
 		 73 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  38.96 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.85 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0110  conserved hypothetical protein, NifU family protein  41.54 
 
 		 91 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000197902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.98 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1070  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.03 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  40.26 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  50.85 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  42.03 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>