263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0430 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  80.21 
 
 		 188 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  79.68 
 
 		 188 aa  312  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  78.72 
 
 		 188 aa  309  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  73.16 
 
 		 190 aa  288  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  71.81 
 
 		 189 aa  287  5.0000000000000004e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  74.21 
 
 		 190 aa  282  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  74.21 
 
 		 190 aa  282  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  70.21 
 
 		 189 aa  276  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  67.02 
 
 		 188 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  68.28 
 
 		 186 aa  270  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  67.89 
 
 		 192 aa  269  2e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  66.49 
 
 		 187 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  70.22 
 
 		 188 aa  262  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  64.36 
 
 		 188 aa  260  6.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  64.36 
 
 		 188 aa  260  6.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  64.36 
 
 		 188 aa  259  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  67.98 
 
 		 188 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  68.09 
 
 		 187 aa  249  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  66.67 
 
 		 188 aa  244  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  64.09 
 
 		 191 aa  244  6e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  63.64 
 
 		 187 aa  243  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  60.43 
 
 		 187 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  64.74 
 
 		 187 aa  241  5e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  63.83 
 
 		 186 aa  240  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  63.89 
 
 		 190 aa  239  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  64.36 
 
 		 188 aa  239  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  64.17 
 
 		 184 aa  238  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  63.83 
 
 		 187 aa  236  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  63.64 
 
 		 201 aa  232  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  59.89 
 
 		 183 aa  231  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  63.83 
 
 		 186 aa  228  5e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  63.83 
 
 		 186 aa  228  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1051  scaffold protein Nfu/NifU  60.96 
 
 		 187 aa  223  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.906453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  57.37 
 
 		 190 aa  220  9e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  56.38 
 
 		 192 aa  216  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  60.43 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  58.73 
 
 		 187 aa  207  6e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  56.15 
 
 		 189 aa  206  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  53.97 
 
 		 187 aa  202  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  53.93 
 
 		 195 aa  198  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  51.6 
 
 		 191 aa  192  3e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  51.03 
 
 		 206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  49.2 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  45.45 
 
 		 180 aa  178  4e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01900  iron ion homeostasis-related protein, putative  51.85 
 
 		 309 aa  176  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  46.77 
 
 		 326 aa  175  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  47.96 
 
 		 186 aa  171  7.999999999999999e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  45.03 
 
 		 254 aa  170  9e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.51 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  43.81 
 
 		 195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  41.49 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.32 
 
 		 198 aa  138  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  39.89 
 
 		 191 aa  134  9e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.82 
 
 		 198 aa  114  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  33.86 
 
 		 299 aa  113  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  34.01 
 
 		 305 aa  109  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.13 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.24 
 
 		 299 aa  95.1  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  30.05 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  26.18 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2988  nitrogen-fixing NifU domain protein  26.67 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.86 
 
 		 72 aa  68.2  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.1 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  43.42 
 
 		 80 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0330  nitrogen-fixing NifU-like protein  40.85 
 
 		 91 aa  63.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  43.42 
 
 		 80 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  43.28 
 
 		 80 aa  63.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  44.59 
 
 		 80 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.12 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  34.34 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  45.16 
 
 		 78 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1632  NifU-like protein  47.54 
 
 		 72 aa  60.5  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000186996  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  46.77 
 
 		 75 aa  60.8  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.07 
 
 		 81 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.62 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  42.62 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.5 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.62 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  41.43 
 
 		 75 aa  60.1  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  45.16 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.28 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46593  predicted protein  44.83 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.78436  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.62 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  42.86 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.29 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  43.55 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  43.55 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  43.55 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  43.55 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.27 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.89 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  40.32 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  43.55 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  43.55 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  43.55 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  43.55 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  43.55 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  43.55 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.67 
 
 		 306 aa  58.5  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>