213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1483 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1483  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 281 aa  551  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.530906  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1875  nitrogen-fixing NifU domain protein  76.23 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0128  NifU domain protein  57.53 
 
 		 130 aa  80.9  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.202734  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0299  nitrogen-fixing NifU domain protein  57.53 
 
 		 127 aa  80.5  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120808 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.43 
 
 		 81 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00755  NifU protein, putative  45.59 
 
 		 80 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0945933  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  44.78 
 
 		 74 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  42.31 
 
 		 78 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.57 
 
 		 72 aa  63.5  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.23 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  42.47 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  40 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  41.03 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  41.03 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  41.03 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  41.03 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  41.03 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  41.03 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  41.03 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  41.03 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  41.03 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  41.03 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  49.25 
 
 		 103 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.03 
 
 		 87 aa  61.6  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  44.62 
 
 		 72 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  44.78 
 
 		 81 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.15 
 
 		 76 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.83 
 
 		 77 aa  60.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.72 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  44.62 
 
 		 75 aa  60.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  41.79 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  45.45 
 
 		 81 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  46.58 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  43.28 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  39.74 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.97 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  41.79 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  48.39 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  41.79 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  40.58 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  40.58 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  41.79 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  41.79 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  40.24 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.3 
 
 		 74 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  41.46 
 
 		 186 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.28 
 
 		 73 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.08 
 
 		 79 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  41.46 
 
 		 186 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.44 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.08 
 
 		 79 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  42.65 
 
 		 74 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.28 
 
 		 73 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  40.54 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  43.08 
 
 		 72 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  48.57 
 
 		 75 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  37.5 
 
 		 81 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  43.06 
 
 		 75 aa  58.2  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1326  NifU domain-containing protein  41.54 
 
 		 79 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02790  NifU C-terminal domain-containing protein, VnfU  52.63 
 
 		 96 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  41.18 
 
 		 74 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  39.39 
 
 		 81 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  43.06 
 
 		 80 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  37.63 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  40.54 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  39.39 
 
 		 81 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  39.39 
 
 		 81 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  44.78 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.83 
 
 		 86 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  39.71 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  41.54 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  46.15 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  42.86 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  39.13 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  35.82 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  41.18 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  40 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  38.24 
 
 		 186 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.76 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  46.27 
 
 		 333 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.94 
 
 		 73 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  34.44 
 
 		 187 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  45.16 
 
 		 74 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  41.18 
 
 		 186 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.04 
 
 		 183 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  43.86 
 
 		 187 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  43.86 
 
 		 184 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.17 
 
 		 78 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2358  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.62 
 
 		 86 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  40.35 
 
 		 201 aa  53.9  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  38.81 
 
 		 74 aa  53.5  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.48 
 
 		 77 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 		 73 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.28 
 
 		 78 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  38.46 
 
 		 79 aa  53.9  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  47.62 
 
 		 86 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213209  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.83 
 
 		 79 aa  53.5  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0994  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.21 
 
 		 78 aa  53.9  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  36 
 
 		 187 aa  53.5  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>