181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0128 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0128  NifU domain protein  100 
 
 		 130 aa  263  8e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.202734  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0299  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 127 aa  256  6e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120808 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1875  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.41 
 
 		 299 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1483  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.41 
 
 		 281 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.530906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  46.38 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  46.38 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  46.38 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  46.38 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  46.38 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  46.38 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  46.38 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  46.38 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  46.38 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  46.38 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  55.36 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  44.93 
 
 		 78 aa  62  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  50.77 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.31 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  46.97 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.72 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  42.03 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  40.58 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  40.58 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.17 
 
 		 283 aa  57  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.38 
 
 		 73 aa  57  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.72 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  48.48 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  44.78 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.24 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  43.55 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.96 
 
 		 329 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  41.51 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.55 
 
 		 285 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  50 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.68 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  44.64 
 
 		 73 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  43.08 
 
 		 333 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.28 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 87 aa  50.8  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  45.45 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.4 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  39.66 
 
 		 213 aa  51.2  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1782  NifU family protein  45.16 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.57 
 
 		 77 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.27 
 
 		 328 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.98 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.23 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.24 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  51.06 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  44.07 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1256  NifU domain-containing protein  36.49 
 
 		 241 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  42.65 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  29.17 
 
 		 191 aa  48.9  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0531  nitrogen fixation protein  37.84 
 
 		 246 aa  48.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.035039  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.18 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0994  nitrogen-fixing NifU domain protein  40 
 
 		 78 aa  48.9  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2183  NifU domain-containing protein  37.84 
 
 		 246 aa  48.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260417 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  41.51 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  41.51 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  43.94 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.86 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  33.33 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.68 
 
 		 291 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1492  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.98 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0512001  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02790  NifU C-terminal domain-containing protein, VnfU  52.5 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.67 
 
 		 280 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  39.39 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.94 
 
 		 73 aa  47.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  42.86 
 
 		 73 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  39.62 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.32 
 
 		 73 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.62 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  39.62 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  39.08 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  39.62 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2270  nitrogen-fixing NifU-like  44.26 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.228591  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.5 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.5 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.75 
 
 		 281 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  39.62 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  39.62 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  39.62 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  39.62 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2358  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.08 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.29 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.82 
 
 		 298 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  41.18 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0484  NifU domain-containing protein  35.94 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  37.5 
 
 		 312 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  43.48 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4936  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.33 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  37.93 
 
 		 186 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  41.38 
 
 		 201 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0419  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.08 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.67 
 
 		 309 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  42.59 
 
 		 331 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  37.5 
 
 		 190 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  38.64 
 
 		 86 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213209  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49030  NifU C-terminal domain-containing protein, AnfU  45.24 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.51 
 
 		 344 aa  44.7  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>