More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2183 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2183  NifU domain-containing protein  100 
 
 		 246 aa  471  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260417 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0531  nitrogen fixation protein  98.78 
 
 		 246 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.035039  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1256  NifU domain-containing protein  74.8 
 
 		 241 aa  335  5e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  33.33 
 
 		 291 aa  151  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.33 
 
 		 291 aa  151  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.66 
 
 		 298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.36 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.96 
 
 		 286 aa  125  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.51 
 
 		 283 aa  122  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  29.39 
 
 		 284 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.48 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.09 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  27.64 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.18 
 
 		 284 aa  112  6e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.17 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.21 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  28.47 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.21 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.47 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.32 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  29.93 
 
 		 288 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.42 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.75 
 
 		 344 aa  102  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.86 
 
 		 306 aa  99  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.4 
 
 		 329 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.63 
 
 		 309 aa  96.3  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.1 
 
 		 309 aa  94  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  40.48 
 
 		 312 aa  92.4  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  28.37 
 
 		 291 aa  92  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  49.06 
 
 		 333 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  58.57 
 
 		 331 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.43 
 
 		 300 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.18 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  28.37 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0484  NifU domain-containing protein  57.35 
 
 		 106 aa  86.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2270  nitrogen-fixing NifU-like  55.56 
 
 		 99 aa  86.3  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.228591  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.35 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  40.34 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  35.34 
 
 		 122 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  36.84 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0107  NifU domain-containing protein  48.1 
 
 		 121 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.826994 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  32.81 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  32 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  35.4 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  34.19 
 
 		 125 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.48 
 
 		 138 aa  78.2  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5908  putative nifU protein  42.86 
 
 		 96 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  37.4 
 
 		 147 aa  77  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  30.95 
 
 		 129 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  32.5 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  35.4 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  35.38 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49030  NifU C-terminal domain-containing protein, AnfU  42.86 
 
 		 96 aa  74.7  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  31.3 
 
 		 123 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.23 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.4 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0835  NifU domain-containing protein  29.82 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.14 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  35.9 
 
 		 153 aa  72  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0951  NifU domain-containing protein  29.31 
 
 		 127 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1947  NifU domain-containing protein  33.33 
 
 		 133 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.5 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2605  nitrogen-fixing NifU domain protein  40 
 
 		 153 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000897774  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  30.51 
 
 		 137 aa  70.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  30.58 
 
 		 142 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  30.58 
 
 		 144 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.5 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_822  NifU domain protein  28.45 
 
 		 127 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02790  NifU C-terminal domain-containing protein, VnfU  47.3 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  30.33 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  34.45 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  31.15 
 
 		 129 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  37.17 
 
 		 129 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.72 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  31.58 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  37.8 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  30.09 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  29.75 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  29.41 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  30.17 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0207  IscU protein  30.77 
 
 		 203 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.45 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  28.69 
 
 		 129 aa  64.3  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1928  NifU domain-containing protein  38.74 
 
 		 156 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.46543  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  28.91 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1354  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  35.59 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0869  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.28 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2001  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.93 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.488301 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  31.67 
 
 		 211 aa  62  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0366  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.23 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.041625  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2231  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.91 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0093  NifU-related protein  26.15 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.467374  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0653  NifU domain-containing protein  28.32 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000132683  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0236  IscU protein  28.21 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2443  NifU-like protein  28.83 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2362  NifU domain-containing protein  23.73 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.201706  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  32.61 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  34.33 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2174  nitrogen-fixing NifU domain protein  24.86 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.7 
 
 		 79 aa  57.4  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>