More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0653 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0653  NifU domain-containing protein  100 
 
 		 163 aa  337  4e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000132683  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  54.92 
 
 		 129 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  58.62 
 
 		 124 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  55.37 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.38 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  56.2 
 
 		 123 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  56.03 
 
 		 125 aa  137  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  56.03 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  51.52 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  54.24 
 
 		 173 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.54 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  50.79 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.8 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  50.85 
 
 		 144 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.85 
 
 		 142 aa  130  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  53.39 
 
 		 137 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1947  NifU domain-containing protein  44.72 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.72 
 
 		 124 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.43 
 
 		 146 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  54.9 
 
 		 125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  45.45 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  45.59 
 
 		 144 aa  124  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  49.19 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  47.33 
 
 		 139 aa  121  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  49.14 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.76 
 
 		 284 aa  118  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  46.61 
 
 		 291 aa  118  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.61 
 
 		 291 aa  118  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  44.3 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.83 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  45.9 
 
 		 143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  45.76 
 
 		 312 aa  117  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  48.28 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 207 aa  116  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.62 
 
 		 154 aa  116  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.07 
 
 		 286 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  42.36 
 
 		 211 aa  114  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.37 
 
 		 309 aa  113  8.999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.22 
 
 		 277 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.07 
 
 		 298 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.22 
 
 		 284 aa  112  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.22 
 
 		 284 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  44.17 
 
 		 211 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.76 
 
 		 277 aa  110  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.72 
 
 		 281 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  47.54 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  47.54 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  47.54 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  47.54 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  47.54 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.55 
 
 		 281 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.37 
 
 		 329 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  47.54 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  47.54 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  47.54 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  47.54 
 
 		 139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  44.83 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2904  scaffold protein  47.54 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146516  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  46.72 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  46.72 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  46.72 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  46.72 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  46.72 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  46.72 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0718  scaffold protein  47.54 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0835  NifU domain-containing protein  43.8 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01056  scaffold protein  45.9 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.3 
 
 		 280 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0282  scaffold protein  46.72 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.76 
 
 		 288 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0278  scaffold protein  45.9 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334373  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004359  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein IscU  45.9 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.901074  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  42.97 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.4 
 
 		 300 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.83 
 
 		 283 aa  105  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  45.53 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1562  FeS cluster assembly scaffold IscU  46.72 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.43451 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  45.9 
 
 		 133 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  46.72 
 
 		 128 aa  105  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  46.72 
 
 		 128 aa  105  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.86 
 
 		 344 aa  104  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1105  FeS cluster assembly scaffold IscU  45.9 
 
 		 128 aa  104  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  43.8 
 
 		 133 aa  103  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  45.9 
 
 		 128 aa  103  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1568  scaffold protein  45.08 
 
 		 150 aa  103  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.497766 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3626  scaffold protein  45.9 
 
 		 128 aa  103  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.284747  normal  0.811196 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  42.96 
 
 		 135 aa  103  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  45.9 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0533  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.06 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  45.53 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  45.9 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3104  scaffold protein  42.86 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  45.08 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0434  scaffold protein  45.08 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163571 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1169  scaffold protein  45.08 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.310149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2654  scaffold protein  42.86 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.32 
 
 		 306 aa  102  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  44.96 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  45.9 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>