More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0174 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  100 
 
 
125 aa  256  1e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  74.59 
 
 
124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  72.95 
 
 
125 aa  193  8.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  72.73 
 
 
129 aa  191  4e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  70.73 
 
 
123 aa  190  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  69.42 
 
 
129 aa  188  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  71.67 
 
 
124 aa  185  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  68.6 
 
 
138 aa  180  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  68.07 
 
 
131 aa  179  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  67.2 
 
 
149 aa  178  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  59.2 
 
 
144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  59.2 
 
 
142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  64.75 
 
 
137 aa  170  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  65.57 
 
 
127 aa  170  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  62.9 
 
 
129 aa  169  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  60 
 
 
144 aa  168  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  61.42 
 
 
173 aa  167  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  60.8 
 
 
146 aa  167  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  60 
 
 
143 aa  166  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  62.4 
 
 
143 aa  165  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  67.23 
 
 
137 aa  166  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  60.33 
 
 
150 aa  163  9e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  58.4 
 
 
145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  63.41 
 
 
153 aa  160  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  59.66 
 
 
122 aa  156  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  59.02 
 
 
153 aa  154  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.92 
 
 
154 aa  147  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  52.46 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  56.3 
 
 
207 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  53.28 
 
 
211 aa  140  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  55.08 
 
 
312 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  55.2 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  50.82 
 
 
211 aa  137  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  55.2 
 
 
128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  55.2 
 
 
128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  55.2 
 
 
128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  55.2 
 
 
128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  55.2 
 
 
128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  54.84 
 
 
133 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  54.4 
 
 
128 aa  136  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  54.4 
 
 
128 aa  136  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.4 
 
 
128 aa  136  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  54.4 
 
 
128 aa  136  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  55.28 
 
 
139 aa  135  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  54.4 
 
 
128 aa  136  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  54.4 
 
 
128 aa  136  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  54.4 
 
 
128 aa  136  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  54.4 
 
 
128 aa  136  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  54.4 
 
 
128 aa  136  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.84 
 
 
143 aa  135  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  54.84 
 
 
143 aa  135  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  50.78 
 
 
153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  53.91 
 
 
153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.97 
 
 
128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0282  scaffold protein  56.45 
 
 
127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.24 
 
 
291 aa  134  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0653  NifU domain-containing protein  53.85 
 
 
163 aa  134  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000132683  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  52.76 
 
 
182 aa  134  4e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0619  scaffold protein  53.12 
 
 
153 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2904  scaffold protein  54.4 
 
 
128 aa  134  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146516  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  54.24 
 
 
291 aa  134  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 
124 aa  134  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0628  scaffold protein  53.12 
 
 
153 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  55.65 
 
 
128 aa  134  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.23 
 
 
128 aa  134  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  55.65 
 
 
128 aa  134  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0278  scaffold protein  55.2 
 
 
127 aa  133  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334373  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  52.42 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  55.28 
 
 
129 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01056  scaffold protein  55.2 
 
 
127 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1562  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.91 
 
 
137 aa  132  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.43451 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.69 
 
 
298 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  56.45 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004359  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein IscU  54.4 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.901074  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1105  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.03 
 
 
128 aa  131  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0835  NifU domain-containing protein  49.57 
 
 
127 aa  131  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  50.81 
 
 
133 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_002978  WD0889  scaffold protein  52.8 
 
 
127 aa  130  5e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112954  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1443  scaffold protein  48.82 
 
 
148 aa  130  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0899521  normal  0.0121231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.81 
 
 
135 aa  130  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.54 
 
 
309 aa  130  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  54.03 
 
 
127 aa  130  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  54.84 
 
 
127 aa  130  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  49.57 
 
 
131 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3626  scaffold protein  54.03 
 
 
128 aa  130  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.284747  normal  0.811196 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2204  scaffold protein  52.8 
 
 
127 aa  130  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00285299  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_822  NifU domain protein  50 
 
 
127 aa  130  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.85 
 
 
284 aa  129  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0951  NifU domain-containing protein  49.17 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0885  scaffold protein  50 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1478  scaffold protein  53.23 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.671651  hitchhiker  0.00720513 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1165  scaffold protein  51.59 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0089491  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  53.23 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  50 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.18 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.85 
 
 
284 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  50.4 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  50.81 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  50.81 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1568  scaffold protein  50 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.497766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>