More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1713 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  100 
 
 		 127 aa  259  6.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  85.95 
 
 		 149 aa  215  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  75.41 
 
 		 125 aa  201  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  76.03 
 
 		 143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  75.21 
 
 		 144 aa  197  5e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  76.86 
 
 		 123 aa  196  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  72.36 
 
 		 124 aa  191  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  73.55 
 
 		 145 aa  190  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  69.42 
 
 		 144 aa  190  7e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  69.42 
 
 		 142 aa  189  9e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  77.95 
 
 		 153 aa  189  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  71.67 
 
 		 129 aa  187  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  74.17 
 
 		 124 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  66.94 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  73.55 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  70 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  65.87 
 
 		 138 aa  178  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  61.16 
 
 		 129 aa  166  8e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  61.29 
 
 		 137 aa  166  9e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  58.68 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  62.1 
 
 		 173 aa  165  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  58.2 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  63.25 
 
 		 122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  64.71 
 
 		 137 aa  159  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  63.71 
 
 		 127 aa  156  9e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  61.42 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  65.57 
 
 		 125 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0889  scaffold protein  57.94 
 
 		 127 aa  151  2e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112954  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  64.46 
 
 		 129 aa  151  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  58.2 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  61.29 
 
 		 127 aa  151  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  57.94 
 
 		 133 aa  150  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  57.48 
 
 		 128 aa  150  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0885  scaffold protein  57.94 
 
 		 133 aa  150  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  58.27 
 
 		 128 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  58.27 
 
 		 128 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  55.81 
 
 		 143 aa  150  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  55.81 
 
 		 143 aa  150  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  57.48 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  57.48 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  57.48 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  60.98 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  61.29 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  57.48 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  57.48 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  57.48 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  57.48 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  57.48 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  58.06 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1059  scaffold protein  56.25 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.78 
 
 		 286 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  58.06 
 
 		 128 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  55.74 
 
 		 154 aa  148  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1105  FeS cluster assembly scaffold IscU  57.48 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  58.06 
 
 		 128 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  55.12 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.17 
 
 		 284 aa  147  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  56.69 
 
 		 128 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  58.87 
 
 		 127 aa  148  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  56.69 
 
 		 128 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  56.69 
 
 		 128 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  56.69 
 
 		 128 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  56.69 
 
 		 128 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  55.12 
 
 		 128 aa  148  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2501  scaffold protein  60.48 
 
 		 127 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0368834  normal  0.021811 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.17 
 
 		 284 aa  147  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3626  scaffold protein  56.69 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.284747  normal  0.811196 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2396  scaffold protein  60.48 
 
 		 127 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  56.35 
 
 		 135 aa  147  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1962  scaffold protein  60.48 
 
 		 127 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0186056  hitchhiker  0.00197009 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2385  scaffold protein  60.48 
 
 		 127 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000223926  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  58.06 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2148  scaffold protein  60.48 
 
 		 127 aa  147  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245787  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2265  scaffold protein  60.48 
 
 		 127 aa  147  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0409  scaffold protein  55.38 
 
 		 138 aa  147  5e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0630  scaffold protein  56.69 
 
 		 137 aa  147  5e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2904  scaffold protein  57.48 
 
 		 128 aa  147  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146516  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1026  scaffold protein  57.26 
 
 		 133 aa  147  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00834233  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1740  scaffold protein  60.48 
 
 		 127 aa  147  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1820  scaffold protein  60.48 
 
 		 127 aa  147  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00411311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2279  scaffold protein  60.48 
 
 		 127 aa  147  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0078288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  54.26 
 
 		 182 aa  147  6e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  56.8 
 
 		 128 aa  147  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1239  scaffold protein  58.4 
 
 		 126 aa  147  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  59.2 
 
 		 127 aa  147  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  59.52 
 
 		 134 aa  146  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  57.26 
 
 		 133 aa  147  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40390  scaffold protein  57.26 
 
 		 128 aa  146  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1325  scaffold protein  58.87 
 
 		 128 aa  146  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2142  scaffold protein  53.85 
 
 		 135 aa  146  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2443  NifU-like protein  53.6 
 
 		 128 aa  146  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5952  scaffold protein  53.85 
 
 		 135 aa  146  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2125  scaffold protein  53.85 
 
 		 135 aa  146  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  58.73 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2289  scaffold protein  56 
 
 		 133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0320081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1165  scaffold protein  56.45 
 
 		 128 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0089491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  57.26 
 
 		 153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  53.12 
 
 		 133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.26 
 
 		 139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2423  scaffold protein  58.87 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>