More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1409 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  100 
 
 		 131 aa  270  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2605  nitrogen-fixing NifU domain protein  58.27 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000897774  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1928  NifU domain-containing protein  66.1 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.46543  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  57.63 
 
 		 124 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.24 
 
 		 138 aa  148  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  54.24 
 
 		 125 aa  147  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  52.14 
 
 		 123 aa  143  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.54 
 
 		 124 aa  140  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2443  NifU-like protein  46.83 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  53.39 
 
 		 142 aa  138  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  53.39 
 
 		 144 aa  138  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  53.85 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  52.54 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.14 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  52.14 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  52.14 
 
 		 143 aa  134  5e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  48.82 
 
 		 173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  50.82 
 
 		 122 aa  133  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  53.39 
 
 		 144 aa  133  8e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1947  NifU domain-containing protein  52.76 
 
 		 133 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  48.03 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  55.93 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  51.72 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  50 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  46.22 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  50 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  47.11 
 
 		 139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0021  NifU-like protein  48.82 
 
 		 143 aa  124  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.13876e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.42 
 
 		 291 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  50.42 
 
 		 291 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.59 
 
 		 284 aa  120  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.59 
 
 		 284 aa  120  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.92 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.07 
 
 		 153 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.33 
 
 		 286 aa  118  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  45.16 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  50 
 
 		 312 aa  117  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  45.76 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.22 
 
 		 344 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.42 
 
 		 298 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.21 
 
 		 329 aa  114  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  46.61 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  49.57 
 
 		 125 aa  114  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.74 
 
 		 277 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.8 
 
 		 277 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.59 
 
 		 124 aa  110  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.9 
 
 		 309 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.35 
 
 		 283 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.38 
 
 		 284 aa  108  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  50.85 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  50 
 
 		 288 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0653  NifU domain-containing protein  44.83 
 
 		 163 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000132683  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.15 
 
 		 281 aa  107  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  47.97 
 
 		 182 aa  105  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.5 
 
 		 290 aa  103  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  45.83 
 
 		 285 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  46.77 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  46.03 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  46.03 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2423  scaffold protein  47.2 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.02 
 
 		 278 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.22 
 
 		 280 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.67 
 
 		 286 aa  101  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  45.9 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0282  scaffold protein  44 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  45.9 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  45.08 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  44.19 
 
 		 139 aa  100  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  45.9 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.97 
 
 		 281 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.83 
 
 		 207 aa  100  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  46.28 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  46.28 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0718  scaffold protein  47.93 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.72 
 
 		 281 aa  100  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  44.63 
 
 		 128 aa  100  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  46.28 
 
 		 135 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  46.28 
 
 		 127 aa  100  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  44.09 
 
 		 135 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3998  FeS cluster assembly scaffold IscU  45.53 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455021  hitchhiker  0.00958668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  47.11 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  45.45 
 
 		 128 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  45.45 
 
 		 128 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  45.53 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  47.11 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  46.28 
 
 		 135 aa  99.4  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  44.63 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  43.44 
 
 		 128 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  43.8 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  44.72 
 
 		 133 aa  98.6  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  44.72 
 
 		 133 aa  98.6  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1294  scaffold protein  46.28 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691863  normal  0.0125117 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2385  scaffold protein  44.8 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000223926  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  43.44 
 
 		 128 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2148  scaffold protein  44.8 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245787  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  43.44 
 
 		 128 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1568  scaffold protein  45.08 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.497766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  43.44 
 
 		 128 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1740  scaffold protein  44.8 
 
 		 127 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2279  scaffold protein  44.8 
 
 		 127 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0078288  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>