More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2906 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  100 
 
 		 146 aa  302  1.0000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  76.56 
 
 		 149 aa  198  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  63.04 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  63.04 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  73.55 
 
 		 127 aa  186  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  71.07 
 
 		 124 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  65.32 
 
 		 129 aa  179  8.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  63.04 
 
 		 145 aa  178  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  67.21 
 
 		 124 aa  178  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  67.21 
 
 		 125 aa  177  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  66.4 
 
 		 143 aa  177  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  75 
 
 		 153 aa  176  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  60.28 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  64.52 
 
 		 123 aa  173  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  63.28 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  59.38 
 
 		 138 aa  160  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  61.98 
 
 		 150 aa  157  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  58.47 
 
 		 137 aa  154  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  55.12 
 
 		 173 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  56.56 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  56.91 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  60.8 
 
 		 125 aa  149  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  55.83 
 
 		 129 aa  147  7e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1562  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.54 
 
 		 137 aa  146  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.43451 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  55.37 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0619  scaffold protein  53.6 
 
 		 153 aa  143  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0628  scaffold protein  53.6 
 
 		 153 aa  143  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  52.5 
 
 		 129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  52.8 
 
 		 153 aa  143  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.32 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.14 
 
 		 283 aa  142  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  52.38 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  51.54 
 
 		 139 aa  141  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.6 
 
 		 143 aa  141  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  52.38 
 
 		 153 aa  141  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.24 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  53.6 
 
 		 143 aa  141  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  52.38 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.82 
 
 		 128 aa  139  9e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4611  scaffold protein  52.76 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.18 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40390  scaffold protein  50 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0843  scaffold protein  51.97 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0886  scaffold protein  51.97 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272267  hitchhiker  0.000151152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1238  scaffold protein  51.97 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  50.4 
 
 		 133 aa  137  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0873  scaffold protein  51.97 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.207282 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0885  scaffold protein  50.4 
 
 		 133 aa  137  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  55.28 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1424  iron-binding protein IscU  51.97 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.81 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4335  scaffold protein  51.18 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.258722  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  50.4 
 
 		 133 aa  137  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  51.2 
 
 		 128 aa  136  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  51.18 
 
 		 128 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0889  scaffold protein  48.78 
 
 		 127 aa  136  8.999999999999999e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112954  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  53.23 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  50.41 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1951  scaffold protein  49.6 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468917  normal  0.344726 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.84 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  50 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  53.12 
 
 		 182 aa  135  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  48.03 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1443  scaffold protein  49.61 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0899521  normal  0.0121231 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.82 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  48.03 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.41 
 
 		 154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.8 
 
 		 135 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1105  FeS cluster assembly scaffold IscU  47.2 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  45.93 
 
 		 138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  48 
 
 		 133 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  47.2 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  58.06 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1165  scaffold protein  47.24 
 
 		 128 aa  134  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0089491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  49.19 
 
 		 135 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  49.19 
 
 		 135 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.54 
 
 		 291 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  52.54 
 
 		 291 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  48.78 
 
 		 128 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.78 
 
 		 128 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  48.78 
 
 		 128 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  48.78 
 
 		 128 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  48.78 
 
 		 128 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  46.4 
 
 		 133 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1026  scaffold protein  50 
 
 		 133 aa  133  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00834233  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  48.78 
 
 		 128 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  52.85 
 
 		 127 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  48.78 
 
 		 128 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  48.78 
 
 		 128 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1478  scaffold protein  51.22 
 
 		 128 aa  133  9e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.671651  hitchhiker  0.00720513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2904  scaffold protein  48.78 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146516  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1630  scaffold protein  48.8 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00319481  hitchhiker  0.000018396 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0278  scaffold protein  48.39 
 
 		 127 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334373  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1657  scaffold protein  50.81 
 
 		 128 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.269786  hitchhiker  0.00054209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  49.19 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  47.97 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01056  scaffold protein  48.39 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1325  scaffold protein  49.19 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  47.97 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2142  scaffold protein  48.39 
 
 		 135 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>