More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0021 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0021  NifU-like protein  100 
 
 		 143 aa  296  8e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.13876e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  53.85 
 
 		 124 aa  147  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  52.46 
 
 		 123 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  55.08 
 
 		 129 aa  144  5e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  52.14 
 
 		 125 aa  139  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  48.82 
 
 		 131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2443  NifU-like protein  53.78 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  50 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.24 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  51.69 
 
 		 143 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  52.14 
 
 		 122 aa  133  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  52.14 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.42 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  48.72 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50 
 
 		 131 aa  130  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  48.41 
 
 		 137 aa  130  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  50.43 
 
 		 144 aa  130  6.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  48.72 
 
 		 173 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  50 
 
 		 125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.17 
 
 		 207 aa  124  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  48.72 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.96 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  47.9 
 
 		 139 aa  122  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.22 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  46.15 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  50.85 
 
 		 211 aa  121  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  47.86 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2605  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.53 
 
 		 153 aa  120  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000897774  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  45.3 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  45 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  45.3 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  45.3 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.9 
 
 		 124 aa  117  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.38 
 
 		 283 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  45.76 
 
 		 211 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.76 
 
 		 277 aa  114  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.35 
 
 		 284 aa  114  5e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.5 
 
 		 154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1928  NifU domain-containing protein  38.24 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.46543  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  45.76 
 
 		 146 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0653  NifU domain-containing protein  42.74 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000132683  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.22 
 
 		 286 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2362  NifU domain-containing protein  41.18 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.201706  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.52 
 
 		 284 aa  103  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.52 
 
 		 284 aa  103  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2174  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.57 
 
 		 203 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  47.01 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.76 
 
 		 344 aa  101  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.3 
 
 		 291 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  37.3 
 
 		 291 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0207  IscU protein  41.67 
 
 		 203 aa  100  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.17 
 
 		 278 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1947  NifU domain-containing protein  37.93 
 
 		 133 aa  100  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.97 
 
 		 281 aa  100  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  44.17 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0533  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.98 
 
 		 200 aa  99.4  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.14 
 
 		 309 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  44.17 
 
 		 127 aa  98.6  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1630  scaffold protein  41.8 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00319481  hitchhiker  0.000018396 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  43.44 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0366  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.39 
 
 		 203 aa  97.8  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.041625  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  44.17 
 
 		 127 aa  97.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  40.68 
 
 		 312 aa  97.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  39.17 
 
 		 130 aa  98.2  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2148  scaffold protein  44.17 
 
 		 127 aa  97.4  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245787  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2385  scaffold protein  44.17 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000223926  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2501  scaffold protein  44.17 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0368834  normal  0.021811 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2396  scaffold protein  44.17 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1325  scaffold protein  41.67 
 
 		 128 aa  97.4  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1962  scaffold protein  44.17 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0186056  hitchhiker  0.00197009 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  41.88 
 
 		 133 aa  97.1  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1026  scaffold protein  41.67 
 
 		 133 aa  97.1  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00834233  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40390  scaffold protein  43.33 
 
 		 128 aa  97.1  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2265  scaffold protein  44.17 
 
 		 127 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1740  scaffold protein  44.17 
 
 		 127 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1820  scaffold protein  44.17 
 
 		 127 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00411311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2279  scaffold protein  44.17 
 
 		 127 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0078288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.53 
 
 		 298 aa  96.7  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0236  IscU protein  37.96 
 
 		 203 aa  96.7  9e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1459  scaffold protein  44.17 
 
 		 127 aa  96.7  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0275409  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  41.8 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.98 
 
 		 277 aa  96.3  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0628  scaffold protein  42.74 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  40.83 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0619  scaffold protein  42.74 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.14 
 
 		 329 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  41.88 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2231  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.41 
 
 		 203 aa  95.9  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  43.86 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  42.5 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  42.5 
 
 		 128 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1059  scaffold protein  40.83 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  41.67 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0885  scaffold protein  41.67 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  42.5 
 
 		 128 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1294  scaffold protein  42.5 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691863  normal  0.0125117 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  40.83 
 
 		 133 aa  94.4  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1478  scaffold protein  39.17 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.671651  hitchhiker  0.00720513 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.74 
 
 		 280 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2001  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.25 
 
 		 203 aa  94  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.488301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>