More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1298 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 
153 aa  316  9e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  73.91 
 
 
154 aa  229  1e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  64.75 
 
 
123 aa  165  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  60.33 
 
 
277 aa  160  6e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  59.5 
 
 
131 aa  160  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  60.47 
 
 
125 aa  159  9e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  55.97 
 
 
149 aa  157  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  57.14 
 
 
284 aa  154  3e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  58.87 
 
 
143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.74 
 
 
145 aa  153  7e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  59.2 
 
 
124 aa  153  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  58.2 
 
 
127 aa  152  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  58.47 
 
 
124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.92 
 
 
150 aa  150  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  54.84 
 
 
129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.92 
 
 
137 aa  150  8e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  56.3 
 
 
137 aa  148  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  54.03 
 
 
129 aa  149  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.98 
 
 
291 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.37 
 
 
286 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  48.98 
 
 
291 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.55 
 
 
284 aa  148  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.55 
 
 
284 aa  148  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  55.28 
 
 
144 aa  147  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  55.28 
 
 
143 aa  147  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  48.3 
 
 
312 aa  146  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.28 
 
 
207 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  55.08 
 
 
138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  55.2 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2174  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.2 
 
 
203 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  52.48 
 
 
173 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  53.66 
 
 
142 aa  144  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  53.66 
 
 
144 aa  144  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  51.16 
 
 
211 aa  142  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.98 
 
 
298 aa  139  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.44 
 
 
329 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0207  IscU protein  45.57 
 
 
203 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  51.09 
 
 
153 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0366  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.2 
 
 
203 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.041625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  54.24 
 
 
122 aa  138  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.9 
 
 
309 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.76 
 
 
146 aa  138  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2362  NifU domain-containing protein  46.2 
 
 
203 aa  138  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.201706  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  59.02 
 
 
125 aa  136  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0533  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.02 
 
 
200 aa  136  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0236  IscU protein  45.57 
 
 
203 aa  136  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2001  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.84 
 
 
203 aa  135  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.488301 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  55.37 
 
 
285 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2231  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.2 
 
 
203 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.59 
 
 
344 aa  135  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.55 
 
 
286 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.9 
 
 
277 aa  132  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  47.29 
 
 
211 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.18 
 
 
283 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.51 
 
 
133 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.51 
 
 
133 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.72 
 
 
288 aa  130  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.89 
 
 
290 aa  130  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.18 
 
 
309 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  48.51 
 
 
138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  51.59 
 
 
182 aa  128  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.79 
 
 
139 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  51.2 
 
 
132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.12 
 
 
132 aa  127  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  51.18 
 
 
130 aa  127  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3998  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.85 
 
 
132 aa  127  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455021  hitchhiker  0.00958668 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.18 
 
 
124 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.07 
 
 
280 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1562  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.54 
 
 
137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.43451 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  49.24 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1951  scaffold protein  50.78 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468917  normal  0.344726 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.71 
 
 
281 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  47.93 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.89 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  50.39 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2289  scaffold protein  48.85 
 
 
133 aa  124  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0320081  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.91 
 
 
276 aa  125  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.82 
 
 
133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  50 
 
 
134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.61 
 
 
306 aa  124  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  46.67 
 
 
143 aa  124  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  46.67 
 
 
143 aa  124  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1046  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.06 
 
 
128 aa  124  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  48.48 
 
 
133 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0885  scaffold protein  48.48 
 
 
133 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  49.21 
 
 
128 aa  123  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.46 
 
 
296 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.59 
 
 
281 aa  123  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  45.93 
 
 
135 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  45.45 
 
 
133 aa  122  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1026  scaffold protein  48.48 
 
 
133 aa  122  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00834233  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0835  NifU domain-containing protein  46.09 
 
 
127 aa  123  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0843  scaffold protein  49.22 
 
 
128 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1059  scaffold protein  49.61 
 
 
133 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0873  scaffold protein  49.22 
 
 
128 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.207282 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0630  scaffold protein  49.22 
 
 
137 aa  122  2e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0886  scaffold protein  49.22 
 
 
128 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272267  hitchhiker  0.000151152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1238  scaffold protein  50 
 
 
128 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  49.22 
 
 
128 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  48.44 
 
 
128 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>