More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0689 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  100 
 
 		 277 aa  559  1e-158  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.32 
 
 		 286 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.71 
 
 		 284 aa  315  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.71 
 
 		 284 aa  315  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.66 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.93 
 
 		 291 aa  305  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  54.93 
 
 		 291 aa  305  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.85 
 
 		 296 aa  305  6e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.99 
 
 		 288 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.51 
 
 		 309 aa  302  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  57.65 
 
 		 281 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.83 
 
 		 280 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  56 
 
 		 276 aa  296  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.93 
 
 		 283 aa  295  4e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.33 
 
 		 306 aa  295  7e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  55.99 
 
 		 285 aa  294  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.85 
 
 		 290 aa  293  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.03 
 
 		 286 aa  292  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.58 
 
 		 293 aa  288  9e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.74 
 
 		 294 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.4 
 
 		 294 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.83 
 
 		 281 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.5 
 
 		 300 aa  285  7e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  58.42 
 
 		 281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.54 
 
 		 278 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  48.14 
 
 		 312 aa  277  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  50 
 
 		 298 aa  277  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.48 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.81 
 
 		 329 aa  264  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.21 
 
 		 277 aa  259  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.54 
 
 		 291 aa  259  4e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.72 
 
 		 344 aa  248  8e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0043  nitrogen fixation protein NifU  41.67 
 
 		 330 aa  205  5e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1697  nitrogen fixation protein NifU  40 
 
 		 333 aa  199  6e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0518954  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0290  NifU family protein  38.73 
 
 		 323 aa  198  9e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0264  NifU family protein  38.73 
 
 		 323 aa  198  9e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1487  NifU-like protein  37.46 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0237  NifU family protein  38.41 
 
 		 323 aa  196  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  38.02 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1162  acetolactate synthase small subunit  38.2 
 
 		 330 aa  192  5e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2153  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.32 
 
 		 329 aa  192  6e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1771  NifU family protein  38.82 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.630256  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2007  nitrogen-fixing NifU-like-like  36.79 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2174  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.21 
 
 		 203 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  45.02 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0366  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.68 
 
 		 203 aa  170  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.041625  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2362  NifU domain-containing protein  45.21 
 
 		 203 aa  168  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.201706  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2231  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.68 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2001  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.11 
 
 		 203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.488301 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0236  IscU protein  45.21 
 
 		 203 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0207  IscU protein  43.62 
 
 		 203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.97 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  60.33 
 
 		 153 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0533  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.21 
 
 		 200 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  52.86 
 
 		 144 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  44.62 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.33 
 
 		 207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  56.49 
 
 		 145 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  55.46 
 
 		 131 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.23 
 
 		 154 aa  143  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  54.07 
 
 		 143 aa  143  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  57.14 
 
 		 149 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  56.78 
 
 		 127 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.17 
 
 		 137 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  54.62 
 
 		 125 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  49.28 
 
 		 211 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  54.62 
 
 		 129 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  55.93 
 
 		 123 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.94 
 
 		 124 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.54 
 
 		 150 aa  132  6e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.64 
 
 		 133 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  52.94 
 
 		 144 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  50.42 
 
 		 129 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.64 
 
 		 133 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.94 
 
 		 142 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.78 
 
 		 138 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  51.67 
 
 		 211 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  52.1 
 
 		 143 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  50.85 
 
 		 129 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3998  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.41 
 
 		 132 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455021  hitchhiker  0.00958668 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  50 
 
 		 132 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  52.1 
 
 		 122 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1046  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.64 
 
 		 128 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  55.08 
 
 		 173 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  50 
 
 		 132 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  51.64 
 
 		 128 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  47.33 
 
 		 137 aa  128  9.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.15 
 
 		 134 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2289  scaffold protein  50.82 
 
 		 133 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0320081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  51.22 
 
 		 182 aa  127  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  51.97 
 
 		 127 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  51.26 
 
 		 139 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  50 
 
 		 139 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  49.18 
 
 		 133 aa  126  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  52.46 
 
 		 127 aa  126  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  52.46 
 
 		 133 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.94 
 
 		 153 aa  125  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  48.09 
 
 		 133 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  51.64 
 
 		 128 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  49.58 
 
 		 124 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>