More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1771 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1162  acetolactate synthase small subunit  91.21 
 
 
330 aa  644    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1771  NifU family protein  100 
 
 
330 aa  685    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.630256  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0043  nitrogen fixation protein NifU  80.61 
 
 
330 aa  567  1e-161  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1487  NifU-like protein  80 
 
 
323 aa  564  1e-160  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0290  NifU family protein  80 
 
 
323 aa  555  1e-157  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0264  NifU family protein  80 
 
 
323 aa  555  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0237  NifU family protein  80 
 
 
323 aa  555  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1697  nitrogen fixation protein NifU  78.68 
 
 
333 aa  543  1e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0518954  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2153  nitrogen-fixing NifU domain protein  77.58 
 
 
329 aa  535  1e-151  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2007  nitrogen-fixing NifU-like-like  68.18 
 
 
324 aa  472  1e-132  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  39.38 
 
 
291 aa  200  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.38 
 
 
291 aa  200  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.29 
 
 
284 aa  199  5e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.89 
 
 
284 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.89 
 
 
284 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.82 
 
 
277 aa  193  3e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.34 
 
 
293 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.37 
 
 
296 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.54 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.78 
 
 
309 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  35.95 
 
 
312 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.54 
 
 
286 aa  179  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.45 
 
 
294 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.45 
 
 
294 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.32 
 
 
306 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.33 
 
 
298 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.45 
 
 
329 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.27 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.49 
 
 
344 aa  170  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.73 
 
 
288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.39 
 
 
277 aa  162  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.42 
 
 
283 aa  162  9e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.73 
 
 
290 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.62 
 
 
286 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  32.72 
 
 
285 aa  156  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.75 
 
 
291 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.58 
 
 
280 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.06 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.31 
 
 
281 aa  153  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.6 
 
 
278 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.61 
 
 
281 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.12 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  29.18 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  29.57 
 
 
333 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  29.02 
 
 
338 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  43.28 
 
 
182 aa  107  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  43.61 
 
 
128 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  38.61 
 
 
149 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1562  FeS cluster assembly scaffold IscU  43.57 
 
 
137 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.43451 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  26.67 
 
 
328 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0302  scaffold protein  42.86 
 
 
142 aa  99.4  8e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.44 
 
 
138 aa  99.4  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1478  scaffold protein  43.28 
 
 
128 aa  99  9e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.671651  hitchhiker  0.00720513 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1951  scaffold protein  42.86 
 
 
127 aa  99  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468917  normal  0.344726 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  42.11 
 
 
125 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1361  FeS cluster assembly scaffold IscU  40.43 
 
 
142 aa  98.6  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  41.67 
 
 
139 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1239  scaffold protein  41.35 
 
 
126 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  43.61 
 
 
130 aa  97.8  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0873  scaffold protein  43.61 
 
 
128 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.207282 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0843  scaffold protein  43.61 
 
 
128 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1238  scaffold protein  43.61 
 
 
128 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0886  scaffold protein  43.61 
 
 
128 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272267  hitchhiker  0.000151152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  44.36 
 
 
128 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  40.15 
 
 
127 aa  97.1  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4335  scaffold protein  43.61 
 
 
128 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.258722  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  41.67 
 
 
124 aa  97.1  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  39.85 
 
 
133 aa  97.1  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1424  iron-binding protein IscU  43.61 
 
 
128 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  41.35 
 
 
127 aa  96.7  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  37.86 
 
 
144 aa  96.7  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1657  scaffold protein  42.54 
 
 
128 aa  96.7  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.269786  hitchhiker  0.00054209 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  41.04 
 
 
127 aa  96.3  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0409  scaffold protein  42.42 
 
 
138 aa  96.7  6e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  42.11 
 
 
135 aa  96.7  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  39.85 
 
 
132 aa  96.3  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  39.85 
 
 
139 aa  96.7  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  41.35 
 
 
133 aa  96.3  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2423  scaffold protein  41.79 
 
 
127 aa  96.3  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  37.59 
 
 
124 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2204  scaffold protein  42.11 
 
 
127 aa  96.3  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00285299  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  39.85 
 
 
138 aa  96.3  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.81 
 
 
207 aa  96.3  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  40.3 
 
 
127 aa  96.3  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1046  FeS cluster assembly scaffold IscU  40.6 
 
 
128 aa  96.3  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  38.64 
 
 
123 aa  95.9  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  43.61 
 
 
128 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0278  scaffold protein  41.35 
 
 
127 aa  95.9  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334373  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  43.61 
 
 
128 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  41.35 
 
 
133 aa  95.9  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  40.6 
 
 
127 aa  95.9  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4611  scaffold protein  42.86 
 
 
128 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0619086  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  40.6 
 
 
128 aa  95.9  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  42.86 
 
 
134 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  41.5 
 
 
153 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1059  scaffold protein  40.88 
 
 
133 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1165  scaffold protein  42.11 
 
 
128 aa  95.1  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0089491  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  42.86 
 
 
135 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0630  scaffold protein  40.91 
 
 
137 aa  95.5  1e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  41.35 
 
 
133 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>