More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1162 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1162  acetolactate synthase small subunit  100 
 
 		 330 aa  683    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1771  NifU family protein  91.21 
 
 		 330 aa  622  1e-177  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.630256  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0043  nitrogen fixation protein NifU  79.7 
 
 		 330 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1487  NifU-like protein  79.7 
 
 		 323 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0290  NifU family protein  79.09 
 
 		 323 aa  551  1e-156  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0264  NifU family protein  79.09 
 
 		 323 aa  551  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0237  NifU family protein  79.09 
 
 		 323 aa  551  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1697  nitrogen fixation protein NifU  75.38 
 
 		 333 aa  527  1e-149  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0518954  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2153  nitrogen-fixing NifU domain protein  76.36 
 
 		 329 aa  525  1e-148  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2007  nitrogen-fixing NifU-like-like  66.67 
 
 		 324 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.42 
 
 		 284 aa  201  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  39.06 
 
 		 291 aa  200  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.06 
 
 		 291 aa  200  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.2 
 
 		 277 aa  192  6e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.69 
 
 		 296 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.66 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.66 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.08 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.8 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.25 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.43 
 
 		 306 aa  182  7e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  36.25 
 
 		 312 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.5 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.09 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.78 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.78 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.25 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.4 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.2 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.09 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.83 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.03 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.03 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.75 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.02 
 
 		 280 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  31.8 
 
 		 285 aa  156  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.59 
 
 		 286 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.65 
 
 		 281 aa  156  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.38 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.12 
 
 		 278 aa  151  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.68 
 
 		 281 aa  142  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.6 
 
 		 281 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  28.33 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  27.3 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  28.57 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  42.11 
 
 		 182 aa  103  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  26.49 
 
 		 328 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1562  FeS cluster assembly scaffold IscU  42.86 
 
 		 137 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.43451 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  37.34 
 
 		 149 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  42.11 
 
 		 128 aa  99.8  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0409  scaffold protein  42.42 
 
 		 138 aa  97.1  4e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1478  scaffold protein  42.54 
 
 		 128 aa  96.3  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.671651  hitchhiker  0.00720513 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0302  scaffold protein  42.11 
 
 		 142 aa  96.3  6e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0630  scaffold protein  41.67 
 
 		 137 aa  96.7  6e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  40.6 
 
 		 125 aa  96.3  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1951  scaffold protein  42.11 
 
 		 127 aa  95.9  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468917  normal  0.344726 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1361  FeS cluster assembly scaffold IscU  39.72 
 
 		 142 aa  95.9  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1046  FeS cluster assembly scaffold IscU  40.6 
 
 		 128 aa  95.9  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  42.11 
 
 		 139 aa  94.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  43.61 
 
 		 128 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1239  scaffold protein  41.04 
 
 		 126 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0843  scaffold protein  42.86 
 
 		 128 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0886  scaffold protein  42.86 
 
 		 128 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272267  hitchhiker  0.000151152 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  37.59 
 
 		 124 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  38.64 
 
 		 127 aa  94  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0873  scaffold protein  42.86 
 
 		 128 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.207282 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1657  scaffold protein  41.79 
 
 		 128 aa  94  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.269786  hitchhiker  0.00054209 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  42.86 
 
 		 130 aa  94  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04655  iron-sulfur cofactor synthesis protein (Isu1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06770)  38.58 
 
 		 173 aa  94  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.593219 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  39.1 
 
 		 133 aa  94  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4335  scaffold protein  42.86 
 
 		 128 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.258722  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1238  scaffold protein  42.86 
 
 		 128 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  39.1 
 
 		 132 aa  93.6  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  39.85 
 
 		 123 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  40.6 
 
 		 133 aa  93.6  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.24 
 
 		 138 aa  93.6  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2423  scaffold protein  41.04 
 
 		 127 aa  93.6  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  39.1 
 
 		 139 aa  93.2  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  40.3 
 
 		 127 aa  93.6  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  41.35 
 
 		 135 aa  93.2  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  40.15 
 
 		 124 aa  93.2  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  36.43 
 
 		 144 aa  93.2  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  40.6 
 
 		 127 aa  93.2  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1424  iron-binding protein IscU  42.86 
 
 		 128 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.06 
 
 		 207 aa  93.2  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  41.04 
 
 		 135 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  41.04 
 
 		 135 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  39.85 
 
 		 127 aa  92.4  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0278  scaffold protein  40.6 
 
 		 127 aa  92.8  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334373  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5431  scaffold protein  41.04 
 
 		 135 aa  92.8  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  39.1 
 
 		 138 aa  92.8  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  40.6 
 
 		 133 aa  92.4  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1630  scaffold protein  42.54 
 
 		 130 aa  92.4  9e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00319481  hitchhiker  0.000018396 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2204  scaffold protein  41.35 
 
 		 127 aa  92.4  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00285299  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5952  scaffold protein  41.04 
 
 		 135 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2142  scaffold protein  41.04 
 
 		 135 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  42.86 
 
 		 128 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  42.86 
 
 		 128 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2125  scaffold protein  41.04 
 
 		 135 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1165  scaffold protein  41.35 
 
 		 128 aa  92.4  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0089491  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>