More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0302 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0302  scaffold protein  100 
 
 		 142 aa  291  1e-78  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1657  scaffold protein  71.09 
 
 		 128 aa  201  4e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.269786  hitchhiker  0.00054209 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1478  scaffold protein  70.31 
 
 		 128 aa  200  5e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.671651  hitchhiker  0.00720513 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  69.6 
 
 		 133 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  69.6 
 
 		 130 aa  195  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40390  scaffold protein  68.8 
 
 		 128 aa  194  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0630  scaffold protein  68.5 
 
 		 137 aa  192  9e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1443  scaffold protein  66.15 
 
 		 148 aa  192  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0899521  normal  0.0121231 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  69.6 
 
 		 127 aa  192  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  68.8 
 
 		 128 aa  192  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1630  scaffold protein  68.5 
 
 		 130 aa  192  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00319481  hitchhiker  0.000018396 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  68.8 
 
 		 128 aa  192  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1562  FeS cluster assembly scaffold IscU  72.58 
 
 		 137 aa  191  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.43451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  67.2 
 
 		 128 aa  191  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  70.16 
 
 		 134 aa  191  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  70.16 
 
 		 135 aa  191  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  69.6 
 
 		 127 aa  191  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  66.15 
 
 		 143 aa  191  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  66.15 
 
 		 143 aa  191  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  69.6 
 
 		 127 aa  191  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  68 
 
 		 133 aa  190  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4611  scaffold protein  66.4 
 
 		 128 aa  189  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0843  scaffold protein  66.4 
 
 		 128 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1424  iron-binding protein IscU  66.4 
 
 		 128 aa  189  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1238  scaffold protein  66.4 
 
 		 128 aa  189  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0886  scaffold protein  66.4 
 
 		 128 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272267  hitchhiker  0.000151152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0873  scaffold protein  66.4 
 
 		 128 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.207282 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  67.2 
 
 		 128 aa  188  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  67.2 
 
 		 128 aa  188  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  67.2 
 
 		 128 aa  188  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0409  scaffold protein  68 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4335  scaffold protein  66.4 
 
 		 128 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.258722  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  67.2 
 
 		 128 aa  188  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  67.2 
 
 		 128 aa  188  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  67.2 
 
 		 128 aa  188  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  67.2 
 
 		 128 aa  188  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  67.2 
 
 		 127 aa  188  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  67.2 
 
 		 128 aa  188  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0619  scaffold protein  66.4 
 
 		 153 aa  187  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0628  scaffold protein  66.4 
 
 		 153 aa  187  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  67.2 
 
 		 128 aa  187  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  67.2 
 
 		 128 aa  187  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  67.2 
 
 		 128 aa  187  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  67.2 
 
 		 128 aa  187  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  66.4 
 
 		 153 aa  187  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  67.2 
 
 		 128 aa  187  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  65.38 
 
 		 153 aa  187  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1059  scaffold protein  63.16 
 
 		 133 aa  187  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1294  scaffold protein  67.2 
 
 		 127 aa  186  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691863  normal  0.0125117 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2904  scaffold protein  67.2 
 
 		 128 aa  186  8e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146516  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  66.4 
 
 		 128 aa  186  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  66.13 
 
 		 139 aa  186  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  66.4 
 
 		 127 aa  186  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  63.7 
 
 		 135 aa  186  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  64.12 
 
 		 132 aa  186  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1026  scaffold protein  66.4 
 
 		 133 aa  186  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00834233  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0278  scaffold protein  68 
 
 		 127 aa  186  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334373  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28374  iron-sulphur assembly protein isc  62.6 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.13011  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0889  scaffold protein  66.4 
 
 		 127 aa  185  2e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112954  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  60.58 
 
 		 138 aa  185  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3626  scaffold protein  66.4 
 
 		 128 aa  185  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.284747  normal  0.811196 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  68.8 
 
 		 182 aa  185  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  62.41 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2148  scaffold protein  66.4 
 
 		 127 aa  184  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245787  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3998  FeS cluster assembly scaffold IscU  65.87 
 
 		 132 aa  184  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455021  hitchhiker  0.00958668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  65.6 
 
 		 137 aa  184  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5952  scaffold protein  62.41 
 
 		 135 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  65.6 
 
 		 128 aa  184  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01056  scaffold protein  67.2 
 
 		 127 aa  184  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2125  scaffold protein  62.41 
 
 		 135 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2142  scaffold protein  62.41 
 
 		 135 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1962  scaffold protein  66.4 
 
 		 127 aa  184  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0186056  hitchhiker  0.00197009 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2265  scaffold protein  66.4 
 
 		 127 aa  184  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2501  scaffold protein  66.4 
 
 		 127 aa  184  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0368834  normal  0.021811 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2385  scaffold protein  66.4 
 
 		 127 aa  184  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000223926  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5431  scaffold protein  62.41 
 
 		 135 aa  184  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  62.41 
 
 		 135 aa  184  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0282  scaffold protein  66.4 
 
 		 127 aa  184  4e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1740  scaffold protein  66.4 
 
 		 127 aa  184  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1820  scaffold protein  66.4 
 
 		 127 aa  184  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00411311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  62.41 
 
 		 135 aa  184  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2396  scaffold protein  66.4 
 
 		 127 aa  184  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2279  scaffold protein  66.4 
 
 		 127 aa  184  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0078288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1165  scaffold protein  65.6 
 
 		 128 aa  183  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0089491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  66.4 
 
 		 128 aa  184  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  66.4 
 
 		 128 aa  184  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1568  scaffold protein  64.34 
 
 		 150 aa  183  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.497766 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  64.84 
 
 		 135 aa  183  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1105  FeS cluster assembly scaffold IscU  65.6 
 
 		 128 aa  183  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004359  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein IscU  66.4 
 
 		 127 aa  183  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.901074  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  61.65 
 
 		 133 aa  183  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  62.41 
 
 		 135 aa  183  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0885  scaffold protein  61.65 
 
 		 133 aa  183  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2654  scaffold protein  64.06 
 
 		 135 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3104  scaffold protein  64.06 
 
 		 135 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  64.8 
 
 		 128 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1169  scaffold protein  64.8 
 
 		 128 aa  182  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.310149  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2598  scaffold protein  64.06 
 
 		 135 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662204  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  65.08 
 
 		 132 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0434  scaffold protein  64.8 
 
 		 128 aa  182  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>