More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2153 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2153  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 329 aa  677    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1771  NifU family protein  76.36 
 
 		 330 aa  524  1e-148  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.630256  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1162  acetolactate synthase small subunit  76.36 
 
 		 330 aa  525  1e-148  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1697  nitrogen fixation protein NifU  75.98 
 
 		 333 aa  526  1e-148  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0518954  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0043  nitrogen fixation protein NifU  74.32 
 
 		 330 aa  520  1e-146  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1487  NifU-like protein  70.21 
 
 		 323 aa  495  1e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0290  NifU family protein  69.6 
 
 		 323 aa  484  1e-135  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0264  NifU family protein  69.6 
 
 		 323 aa  484  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0237  NifU family protein  69.6 
 
 		 323 aa  483  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2007  nitrogen-fixing NifU-like-like  66.87 
 
 		 324 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.81 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  39.81 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.89 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.32 
 
 		 277 aa  192  7e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.28 
 
 		 309 aa  189  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.62 
 
 		 296 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.47 
 
 		 306 aa  188  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.74 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.52 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.78 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.78 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.93 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.39 
 
 		 344 aa  176  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  34.24 
 
 		 312 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.64 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.13 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.23 
 
 		 284 aa  169  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.23 
 
 		 284 aa  169  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.62 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.59 
 
 		 283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  32.52 
 
 		 285 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.02 
 
 		 277 aa  159  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.62 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.17 
 
 		 291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.42 
 
 		 276 aa  155  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.29 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.81 
 
 		 281 aa  153  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.79 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.25 
 
 		 278 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.75 
 
 		 280 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.06 
 
 		 281 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  29.66 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.23 
 
 		 281 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  29.01 
 
 		 333 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  29.36 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  28.15 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  43.7 
 
 		 182 aa  106  6e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  43.61 
 
 		 128 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1478  scaffold protein  42.54 
 
 		 128 aa  99.8  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.671651  hitchhiker  0.00720513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1562  FeS cluster assembly scaffold IscU  43.61 
 
 		 137 aa  99.4  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.43451 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  43.61 
 
 		 130 aa  99  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0628  scaffold protein  43.61 
 
 		 153 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1046  FeS cluster assembly scaffold IscU  41.61 
 
 		 128 aa  98.6  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  41.35 
 
 		 125 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  43.61 
 
 		 153 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0619  scaffold protein  43.61 
 
 		 153 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  44.36 
 
 		 153 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0302  scaffold protein  41.96 
 
 		 142 aa  98.2  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1443  scaffold protein  41.61 
 
 		 148 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0899521  normal  0.0121231 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1361  FeS cluster assembly scaffold IscU  40.43 
 
 		 142 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  39.1 
 
 		 124 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1657  scaffold protein  41.79 
 
 		 128 aa  97.1  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.269786  hitchhiker  0.00054209 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  40.6 
 
 		 127 aa  97.1  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  42.86 
 
 		 139 aa  96.7  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04655  iron-sulfur cofactor synthesis protein (Isu1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06770)  39.57 
 
 		 173 aa  96.7  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.593219 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  42.36 
 
 		 134 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  40.6 
 
 		 127 aa  95.9  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1568  scaffold protein  40.79 
 
 		 150 aa  95.9  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.497766 
 
 
-
 
NC_002978  WD0889  scaffold protein  39.85 
 
 		 127 aa  95.9  8e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112954  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  43.61 
 
 		 128 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  39.85 
 
 		 138 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  43.61 
 
 		 135 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  40.58 
 
 		 133 aa  95.5  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1239  scaffold protein  39.85 
 
 		 126 aa  95.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  40.15 
 
 		 124 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0843  scaffold protein  42.86 
 
 		 128 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0886  scaffold protein  42.86 
 
 		 128 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272267  hitchhiker  0.000151152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1238  scaffold protein  42.86 
 
 		 128 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1951  scaffold protein  41.35 
 
 		 127 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468917  normal  0.344726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0873  scaffold protein  42.86 
 
 		 128 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.207282 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  39.55 
 
 		 127 aa  94.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  40.6 
 
 		 128 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4335  scaffold protein  42.86 
 
 		 128 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.258722  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  43.61 
 
 		 128 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  39.85 
 
 		 127 aa  94.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  43.61 
 
 		 128 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1294  scaffold protein  39.1 
 
 		 127 aa  94  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691863  normal  0.0125117 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1424  iron-binding protein IscU  42.86 
 
 		 128 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  41.35 
 
 		 143 aa  94  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  41.35 
 
 		 143 aa  94  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1059  scaffold protein  41.35 
 
 		 133 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  39.1 
 
 		 149 aa  94.4  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  38.41 
 
 		 132 aa  93.6  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5431  scaffold protein  41.35 
 
 		 135 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1630  scaffold protein  41.35 
 
 		 130 aa  93.6  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00319481  hitchhiker  0.000018396 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  41.35 
 
 		 135 aa  93.2  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  39.1 
 
 		 133 aa  93.6  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  41.35 
 
 		 135 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2423  scaffold protein  39.42 
 
 		 127 aa  93.2  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  41.35 
 
 		 135 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>