More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4135 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  100 
 
 		 291 aa  590  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  66.67 
 
 		 296 aa  394  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  64.67 
 
 		 309 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  61.33 
 
 		 300 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  64.75 
 
 		 294 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  65.99 
 
 		 293 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  64.75 
 
 		 294 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  60.86 
 
 		 306 aa  375  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.04 
 
 		 284 aa  296  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.04 
 
 		 284 aa  296  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.67 
 
 		 288 aa  294  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.68 
 
 		 286 aa  293  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.89 
 
 		 277 aa  289  5.0000000000000004e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.52 
 
 		 278 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.58 
 
 		 280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.67 
 
 		 290 aa  280  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.32 
 
 		 283 aa  276  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.22 
 
 		 291 aa  276  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  51.22 
 
 		 291 aa  276  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.34 
 
 		 281 aa  275  5e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.68 
 
 		 286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  50.17 
 
 		 285 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.17 
 
 		 298 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.2 
 
 		 276 aa  263  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.83 
 
 		 281 aa  263  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.1 
 
 		 281 aa  259  4e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.12 
 
 		 284 aa  258  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  47.4 
 
 		 312 aa  256  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.19 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.37 
 
 		 329 aa  246  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.79 
 
 		 277 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.25 
 
 		 344 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0043  nitrogen fixation protein NifU  34.06 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2153  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.66 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1487  NifU-like protein  33.55 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1162  acetolactate synthase small subunit  34.67 
 
 		 330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0290  NifU family protein  33.54 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0264  NifU family protein  33.54 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1771  NifU family protein  34.37 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.630256  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0237  NifU family protein  33.54 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1697  nitrogen fixation protein NifU  33.13 
 
 		 333 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0518954  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  35 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2007  nitrogen-fixing NifU-like-like  33.44 
 
 		 324 aa  166  5e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  32.65 
 
 		 338 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.93 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  32.16 
 
 		 333 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0236  IscU protein  41.75 
 
 		 203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2231  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.18 
 
 		 203 aa  139  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2174  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.86 
 
 		 203 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0207  IscU protein  38.86 
 
 		 203 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2001  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.71 
 
 		 203 aa  132  5e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.488301 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2362  NifU domain-containing protein  38.54 
 
 		 203 aa  132  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.201706  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0366  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.78 
 
 		 203 aa  132  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.041625  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  46.62 
 
 		 150 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0533  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.04 
 
 		 200 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2423  scaffold protein  53.23 
 
 		 127 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  51.61 
 
 		 139 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  50.81 
 
 		 128 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  49.19 
 
 		 133 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1046  FeS cluster assembly scaffold IscU  49.19 
 
 		 128 aa  122  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  52.42 
 
 		 127 aa  122  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1294  scaffold protein  52.42 
 
 		 127 aa  122  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691863  normal  0.0125117 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  50 
 
 		 138 aa  122  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  52.42 
 
 		 128 aa  122  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  50 
 
 		 130 aa  122  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.21 
 
 		 153 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  51.61 
 
 		 145 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2148  scaffold protein  52.42 
 
 		 127 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245787  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2501  scaffold protein  52.42 
 
 		 127 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0368834  normal  0.021811 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1962  scaffold protein  52.42 
 
 		 127 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0186056  hitchhiker  0.00197009 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1951  scaffold protein  50.81 
 
 		 127 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468917  normal  0.344726 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2385  scaffold protein  52.42 
 
 		 127 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000223926  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  51.2 
 
 		 127 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2289  scaffold protein  50 
 
 		 133 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0320081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2396  scaffold protein  52.42 
 
 		 127 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2279  scaffold protein  52.42 
 
 		 127 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0078288  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2265  scaffold protein  52.42 
 
 		 127 aa  120  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2204  scaffold protein  50 
 
 		 127 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00285299  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  50 
 
 		 133 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3998  FeS cluster assembly scaffold IscU  48 
 
 		 132 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455021  hitchhiker  0.00958668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1740  scaffold protein  52.42 
 
 		 127 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1820  scaffold protein  52.42 
 
 		 127 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00411311  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  51.61 
 
 		 128 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.61 
 
 		 128 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.39 
 
 		 132 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1059  scaffold protein  50.81 
 
 		 133 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  51.61 
 
 		 128 aa  119  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  51.61 
 
 		 128 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  51.61 
 
 		 128 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  50 
 
 		 127 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  51.61 
 
 		 128 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  51.61 
 
 		 128 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1459  scaffold protein  48.84 
 
 		 127 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0275409  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1026  scaffold protein  50.81 
 
 		 133 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00834233  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  51.61 
 
 		 128 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  51.61 
 
 		 128 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  51.61 
 
 		 127 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.4 
 
 		 137 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  50.81 
 
 		 128 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.39 
 
 		 133 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>