More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0303 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  100 
 
 		 137 aa  280  5.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  67.48 
 
 		 123 aa  174  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  70.34 
 
 		 125 aa  172  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  69.23 
 
 		 131 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  70.34 
 
 		 124 aa  170  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  66.95 
 
 		 124 aa  168  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  66.1 
 
 		 138 aa  167  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  65.29 
 
 		 129 aa  167  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  60.74 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  63.11 
 
 		 127 aa  161  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  64.1 
 
 		 129 aa  160  7e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  63.56 
 
 		 173 aa  159  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  65.25 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  61.86 
 
 		 144 aa  156  7e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  53.28 
 
 		 142 aa  156  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  53.28 
 
 		 144 aa  156  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  63.03 
 
 		 143 aa  155  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  58.47 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  61.86 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  61.86 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  53.57 
 
 		 150 aa  152  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  61.02 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  61.02 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.35 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  67.23 
 
 		 125 aa  150  8e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.54 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  64.76 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.83 
 
 		 283 aa  144  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.67 
 
 		 277 aa  143  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  59.17 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  57.5 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  51.16 
 
 		 312 aa  140  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1105  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.33 
 
 		 128 aa  140  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  54.33 
 
 		 128 aa  140  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  54.33 
 
 		 128 aa  140  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  56.67 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  56.67 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  56.67 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  55 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4611  scaffold protein  56.67 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  56.67 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.49 
 
 		 207 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  55 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  56.67 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0843  scaffold protein  56.67 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1238  scaffold protein  56.67 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0873  scaffold protein  56.67 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.207282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0886  scaffold protein  56.67 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272267  hitchhiker  0.000151152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1424  iron-binding protein IscU  56.67 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  55.93 
 
 		 139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4335  scaffold protein  56.67 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.258722  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.22 
 
 		 298 aa  137  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  55.83 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  50 
 
 		 133 aa  137  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  55.83 
 
 		 128 aa  137  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  55.83 
 
 		 128 aa  137  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  55.83 
 
 		 128 aa  137  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  55.83 
 
 		 128 aa  137  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  55.83 
 
 		 128 aa  137  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  55.83 
 
 		 128 aa  137  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  55.83 
 
 		 128 aa  137  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  55.83 
 
 		 128 aa  137  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.46 
 
 		 284 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.46 
 
 		 284 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.62 
 
 		 291 aa  135  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  55 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1568  scaffold protein  53.33 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.497766 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.54 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  50 
 
 		 286 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  54.17 
 
 		 143 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  49.62 
 
 		 291 aa  135  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.17 
 
 		 143 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.69 
 
 		 284 aa  136  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0278  scaffold protein  55.83 
 
 		 127 aa  135  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334373  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1277  scaffold protein  55 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0307655  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  54.17 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_002978  WD0889  scaffold protein  54.17 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112954  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0434  scaffold protein  55 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163571 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3626  scaffold protein  55 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.284747  normal  0.811196 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2904  scaffold protein  55.83 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146516  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.17 
 
 		 281 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1169  scaffold protein  55 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.310149  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40390  scaffold protein  53.33 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0282  scaffold protein  54.17 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.17 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  50.77 
 
 		 133 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01056  scaffold protein  55 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.17 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.94 
 
 		 124 aa  134  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.61 
 
 		 277 aa  134  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.62 
 
 		 309 aa  134  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.33 
 
 		 134 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  53.49 
 
 		 139 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004359  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein IscU  54.17 
 
 		 127 aa  133  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.901074  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2423  scaffold protein  54.17 
 
 		 127 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0619  scaffold protein  54.17 
 
 		 153 aa  133  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.78 
 
 		 135 aa  133  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0628  scaffold protein  54.17 
 
 		 153 aa  133  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1059  scaffold protein  53.33 
 
 		 133 aa  133  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  50 
 
 		 133 aa  133  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>