More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1487 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1487  NifU-like protein  100 
 
 
323 aa  669    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0290  NifU family protein  88.85 
 
 
323 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0237  NifU family protein  88.85 
 
 
323 aa  611  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0264  NifU family protein  88.85 
 
 
323 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1162  acetolactate synthase small subunit  79.7 
 
 
330 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1771  NifU family protein  80 
 
 
330 aa  560  1e-158  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.630256  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0043  nitrogen fixation protein NifU  76.06 
 
 
330 aa  536  1e-151  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1697  nitrogen fixation protein NifU  72.97 
 
 
333 aa  504  9.999999999999999e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0518954  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2153  nitrogen-fixing NifU domain protein  70.21 
 
 
329 aa  495  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2007  nitrogen-fixing NifU-like-like  65.85 
 
 
324 aa  454  1e-127  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.71 
 
 
284 aa  204  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.08 
 
 
284 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.08 
 
 
284 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.46 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  38.85 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.85 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.42 
 
 
309 aa  189  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.42 
 
 
286 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  36.06 
 
 
312 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.75 
 
 
296 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.65 
 
 
309 aa  182  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.29 
 
 
329 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.02 
 
 
298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.51 
 
 
293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.1 
 
 
306 aa  178  9e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.62 
 
 
344 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.36 
 
 
277 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.37 
 
 
288 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.85 
 
 
294 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.85 
 
 
294 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.49 
 
 
300 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.64 
 
 
290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  34.27 
 
 
285 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.97 
 
 
283 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.54 
 
 
286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.26 
 
 
276 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.73 
 
 
281 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.26 
 
 
280 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.55 
 
 
291 aa  155  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.41 
 
 
278 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.09 
 
 
281 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.91 
 
 
281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  28.17 
 
 
331 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  28.41 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  27.32 
 
 
333 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  27.54 
 
 
328 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  41.04 
 
 
182 aa  102  8e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1562  FeS cluster assembly scaffold IscU  42.14 
 
 
137 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.43451 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  37.34 
 
 
149 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1951  scaffold protein  42.86 
 
 
127 aa  99.4  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468917  normal  0.344726 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1046  FeS cluster assembly scaffold IscU  41.35 
 
 
128 aa  99  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  40.6 
 
 
128 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1239  scaffold protein  41.79 
 
 
126 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  40.97 
 
 
139 aa  97.4  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  41.35 
 
 
125 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  41.04 
 
 
127 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2423  scaffold protein  41.79 
 
 
127 aa  98.2  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  42.11 
 
 
135 aa  97.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  41.35 
 
 
127 aa  97.4  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1361  FeS cluster assembly scaffold IscU  41.35 
 
 
142 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  39.85 
 
 
139 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  40.6 
 
 
127 aa  96.7  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  40.3 
 
 
127 aa  96.7  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  40.91 
 
 
124 aa  96.7  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  39.85 
 
 
138 aa  96.7  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  41.79 
 
 
135 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  40.6 
 
 
128 aa  96.3  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2204  scaffold protein  42.11 
 
 
127 aa  96.3  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00285299  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  41.79 
 
 
135 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  39.1 
 
 
133 aa  96.3  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  41.35 
 
 
133 aa  95.9  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1707  scaffold protein  41.79 
 
 
135 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1165  scaffold protein  42.11 
 
 
128 aa  95.9  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0089491  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2732  scaffold protein  41.79 
 
 
135 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5431  scaffold protein  41.79 
 
 
135 aa  95.9  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113721  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2598  scaffold protein  41.79 
 
 
135 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662204  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1568  scaffold protein  38.51 
 
 
150 aa  95.9  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.497766 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2654  scaffold protein  41.79 
 
 
135 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3104  scaffold protein  41.79 
 
 
135 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5952  scaffold protein  41.79 
 
 
135 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1488  scaffold protein  41.79 
 
 
135 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.719074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2142  scaffold protein  41.79 
 
 
135 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2125  scaffold protein  41.79 
 
 
135 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2216  scaffold protein  41.79 
 
 
135 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  41.79 
 
 
135 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0278  scaffold protein  41.35 
 
 
127 aa  95.5  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334373  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.13 
 
 
138 aa  95.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1294  scaffold protein  39.1 
 
 
127 aa  95.1  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691863  normal  0.0125117 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  41.79 
 
 
135 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  39.1 
 
 
132 aa  95.5  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1325  scaffold protein  38.69 
 
 
128 aa  94.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1962  scaffold protein  40.3 
 
 
127 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0186056  hitchhiker  0.00197009 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1059  scaffold protein  40.88 
 
 
133 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2501  scaffold protein  40.3 
 
 
127 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0368834  normal  0.021811 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2396  scaffold protein  40.3 
 
 
127 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0873  scaffold protein  42.86 
 
 
128 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.207282 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  41.79 
 
 
138 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1740  scaffold protein  40.3 
 
 
127 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1820  scaffold protein  40.3 
 
 
127 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00411311  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2385  scaffold protein  40.3 
 
 
127 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000223926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>