More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2273 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  100 
 
 		 124 aa  256  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  80.65 
 
 		 125 aa  220  4.9999999999999996e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  81.82 
 
 		 123 aa  210  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  80.83 
 
 		 124 aa  209  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  74.38 
 
 		 149 aa  194  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  71.9 
 
 		 129 aa  193  8.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  71.9 
 
 		 144 aa  191  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  70.83 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  70.83 
 
 		 144 aa  191  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  72.36 
 
 		 127 aa  191  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  71.54 
 
 		 138 aa  191  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  72.5 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  72.27 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  71.07 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  73.55 
 
 		 153 aa  183  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  72.65 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  65.85 
 
 		 131 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  66.94 
 
 		 129 aa  179  8.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  67.5 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  67.77 
 
 		 146 aa  178  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  67.23 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  74.59 
 
 		 125 aa  174  3e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  66.95 
 
 		 137 aa  167  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  59.84 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  58.68 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  57.26 
 
 		 139 aa  158  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0885  scaffold protein  57.48 
 
 		 133 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  57.48 
 
 		 133 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  57.63 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  58.06 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  58.47 
 
 		 153 aa  151  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  56.69 
 
 		 133 aa  151  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  62.81 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  57.26 
 
 		 128 aa  150  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.1 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  57.6 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  55.12 
 
 		 135 aa  147  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  54.76 
 
 		 135 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  56.35 
 
 		 182 aa  147  6e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  54.76 
 
 		 135 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  55.12 
 
 		 132 aa  147  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.84 
 
 		 133 aa  146  9e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  54.33 
 
 		 137 aa  146  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  54.33 
 
 		 138 aa  146  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0628  scaffold protein  55.65 
 
 		 153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  56.45 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1707  scaffold protein  54.33 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2216  scaffold protein  54.33 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  54.76 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2732  scaffold protein  54.33 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.84 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3104  scaffold protein  54.33 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1488  scaffold protein  54.33 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.719074  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  56.45 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2598  scaffold protein  54.33 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662204  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0619  scaffold protein  55.65 
 
 		 153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2654  scaffold protein  54.33 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  56 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1059  scaffold protein  54.33 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5431  scaffold protein  53.97 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0718  scaffold protein  58.06 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  55.2 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1026  scaffold protein  55.12 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00834233  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5952  scaffold protein  53.97 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2204  scaffold protein  54.76 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00285299  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2142  scaffold protein  53.97 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2125  scaffold protein  53.97 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2289  scaffold protein  53.91 
 
 		 133 aa  144  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0320081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1165  scaffold protein  55.28 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0089491  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  55.28 
 
 		 139 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  54.84 
 
 		 133 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  53.12 
 
 		 132 aa  143  9e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0653  NifU domain-containing protein  58.62 
 
 		 163 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000132683  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.12 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.12 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  54.47 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  54.47 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1325  scaffold protein  55.12 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  54.76 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  54.76 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.76 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.78 
 
 		 291 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  53.91 
 
 		 138 aa  142  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  54.76 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  54.76 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1478  scaffold protein  55.65 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.671651  hitchhiker  0.00720513 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  52.46 
 
 		 211 aa  141  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01056  scaffold protein  53.6 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  53.78 
 
 		 291 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  54.76 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  54.76 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  55.2 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1657  scaffold protein  55.12 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.269786  hitchhiker  0.00054209 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004359  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein IscU  53.6 
 
 		 127 aa  141  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.901074  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  54.76 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  55.65 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.12 
 
 		 133 aa  141  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  52.76 
 
 		 143 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  52.76 
 
 		 143 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  54.76 
 
 		 128 aa  140  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>