More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0721 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  100 
 
 		 149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  85.95 
 
 		 127 aa  215  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  78.17 
 
 		 153 aa  212  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  74.6 
 
 		 144 aa  209  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  77.6 
 
 		 144 aa  209  7.999999999999999e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  74.6 
 
 		 142 aa  209  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  71.94 
 
 		 143 aa  207  5e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  75.4 
 
 		 129 aa  204  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  79.34 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  76.8 
 
 		 145 aa  201  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  73.6 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  76.03 
 
 		 125 aa  200  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  76.56 
 
 		 146 aa  198  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  73.17 
 
 		 123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  74.38 
 
 		 124 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  66.67 
 
 		 138 aa  184  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  67.97 
 
 		 150 aa  180  6e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  65 
 
 		 131 aa  173  7e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  65.12 
 
 		 173 aa  170  7.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  62.5 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  63.11 
 
 		 122 aa  168  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  63.03 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  57.66 
 
 		 137 aa  163  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  67.2 
 
 		 125 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  66.92 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  65.25 
 
 		 137 aa  158  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  55.97 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0619  scaffold protein  53.02 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  52.35 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0628  scaffold protein  53.02 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  51.01 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1562  FeS cluster assembly scaffold IscU  57.69 
 
 		 137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.43451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  58.91 
 
 		 128 aa  154  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  58.91 
 
 		 128 aa  154  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  58.21 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0885  scaffold protein  58.27 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  58.27 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  60.32 
 
 		 127 aa  151  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  57.98 
 
 		 291 aa  151  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  57.98 
 
 		 291 aa  151  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  58.27 
 
 		 133 aa  150  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  58.27 
 
 		 128 aa  150  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  61.11 
 
 		 127 aa  150  8e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  61.11 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  57.14 
 
 		 286 aa  149  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  56.3 
 
 		 312 aa  149  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1424  iron-binding protein IscU  58.14 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1238  scaffold protein  58.14 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1165  scaffold protein  57.03 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0089491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1026  scaffold protein  57.94 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00834233  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.3 
 
 		 284 aa  148  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0843  scaffold protein  57.36 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0873  scaffold protein  57.36 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.207282 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  55.12 
 
 		 143 aa  148  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  55.12 
 
 		 143 aa  148  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  57.48 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.3 
 
 		 284 aa  148  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0886  scaffold protein  57.36 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272267  hitchhiker  0.000151152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40390  scaffold protein  55.81 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2289  scaffold protein  55.81 
 
 		 133 aa  148  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0320081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  57.36 
 
 		 128 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  57.48 
 
 		 134 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  60.32 
 
 		 127 aa  148  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.78 
 
 		 298 aa  148  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1059  scaffold protein  57.14 
 
 		 133 aa  148  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4335  scaffold protein  56.59 
 
 		 128 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.258722  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  57.14 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.24 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  56.69 
 
 		 135 aa  147  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  60.8 
 
 		 147 aa  147  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  56.69 
 
 		 133 aa  147  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  57.03 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  58.4 
 
 		 128 aa  147  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  58.4 
 
 		 128 aa  147  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  56.69 
 
 		 135 aa  147  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4611  scaffold protein  56.59 
 
 		 128 aa  147  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  56.25 
 
 		 139 aa  147  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  55.91 
 
 		 132 aa  147  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  56.25 
 
 		 138 aa  146  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  55.3 
 
 		 135 aa  146  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  59.52 
 
 		 127 aa  146  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2148  scaffold protein  59.06 
 
 		 127 aa  146  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245787  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.73 
 
 		 133 aa  146  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.73 
 
 		 133 aa  146  9e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  56.35 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2265  scaffold protein  59.06 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1951  scaffold protein  56.69 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468917  normal  0.344726 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2501  scaffold protein  59.06 
 
 		 127 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0368834  normal  0.021811 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1105  FeS cluster assembly scaffold IscU  56.69 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  50.74 
 
 		 139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  56.35 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1962  scaffold protein  59.06 
 
 		 127 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0186056  hitchhiker  0.00197009 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  58.97 
 
 		 281 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2396  scaffold protein  59.06 
 
 		 127 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1239  scaffold protein  57.94 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1740  scaffold protein  59.06 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1820  scaffold protein  59.06 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00411311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  56.35 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2385  scaffold protein  59.06 
 
 		 127 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000223926  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2279  scaffold protein  59.06 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0078288  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>