More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1673 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  100 
 
 		 131 aa  270  5.000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  73.77 
 
 		 129 aa  201  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  69.05 
 
 		 129 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  71.07 
 
 		 125 aa  189  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  68.91 
 
 		 123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  65.85 
 
 		 124 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  67.5 
 
 		 124 aa  180  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  67.23 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  65 
 
 		 149 aa  173  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  62.18 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  62.7 
 
 		 137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  69.23 
 
 		 137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  61.67 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  62.5 
 
 		 143 aa  167  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  59.66 
 
 		 142 aa  167  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  59.66 
 
 		 144 aa  167  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  61.34 
 
 		 173 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  61.34 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  60.5 
 
 		 145 aa  163  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  58.2 
 
 		 127 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  59.5 
 
 		 153 aa  160  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  68.07 
 
 		 125 aa  156  7e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  61.67 
 
 		 153 aa  156  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.55 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.55 
 
 		 154 aa  150  5e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  55.93 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  57.6 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  57.6 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  55.74 
 
 		 312 aa  144  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  55.37 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.3 
 
 		 291 aa  143  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  56.3 
 
 		 291 aa  143  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.46 
 
 		 277 aa  144  6e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  58.4 
 
 		 153 aa  143  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  54.69 
 
 		 128 aa  143  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  55.22 
 
 		 182 aa  142  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  55.37 
 
 		 211 aa  142  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  57.48 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  56.45 
 
 		 207 aa  142  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0628  scaffold protein  57.6 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  54.69 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  54.69 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  54.69 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  54.69 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  54.69 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0619  scaffold protein  57.6 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  57.6 
 
 		 128 aa  141  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  57.6 
 
 		 128 aa  141  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  56.8 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  55.47 
 
 		 135 aa  140  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0843  scaffold protein  57.6 
 
 		 128 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0886  scaffold protein  57.6 
 
 		 128 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272267  hitchhiker  0.000151152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1238  scaffold protein  57.6 
 
 		 128 aa  140  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0873  scaffold protein  57.6 
 
 		 128 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.207282 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  50.41 
 
 		 139 aa  140  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  53.91 
 
 		 128 aa  140  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.91 
 
 		 128 aa  140  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.46 
 
 		 284 aa  140  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2216  scaffold protein  55.47 
 
 		 135 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1707  scaffold protein  55.47 
 
 		 135 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3104  scaffold protein  55.47 
 
 		 135 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  53.91 
 
 		 128 aa  140  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  53.91 
 
 		 128 aa  140  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  53.72 
 
 		 211 aa  140  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2732  scaffold protein  55.47 
 
 		 135 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  53.91 
 
 		 128 aa  140  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.46 
 
 		 284 aa  140  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1488  scaffold protein  55.47 
 
 		 135 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.719074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2598  scaffold protein  55.47 
 
 		 135 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  53.91 
 
 		 128 aa  140  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2654  scaffold protein  55.47 
 
 		 135 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  53.91 
 
 		 128 aa  140  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  53.91 
 
 		 128 aa  140  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  54.69 
 
 		 135 aa  140  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4335  scaffold protein  56.8 
 
 		 128 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.258722  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  54.69 
 
 		 135 aa  140  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1424  iron-binding protein IscU  57.6 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2142  scaffold protein  54.69 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5431  scaffold protein  54.69 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5952  scaffold protein  54.69 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2125  scaffold protein  54.69 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  55.2 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  54.69 
 
 		 135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4611  scaffold protein  56.8 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  55.2 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.5 
 
 		 284 aa  139  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2204  scaffold protein  56.69 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00285299  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  56.8 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1105  FeS cluster assembly scaffold IscU  55.2 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.62 
 
 		 286 aa  138  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.76 
 
 		 134 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.4 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  54.69 
 
 		 133 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1165  scaffold protein  55.2 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0089491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.97 
 
 		 135 aa  137  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1277  scaffold protein  54.4 
 
 		 128 aa  137  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0307655  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1951  scaffold protein  55.2 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468917  normal  0.344726 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1169  scaffold protein  54.4 
 
 		 128 aa  137  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.310149  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3626  scaffold protein  53.6 
 
 		 128 aa  137  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.284747  normal  0.811196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.4 
 
 		 135 aa  137  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>