More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2443 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2443  NifU-like protein  100 
 
 		 128 aa  263  7e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  53.6 
 
 		 127 aa  146  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2605  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.62 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000897774  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  50.39 
 
 		 139 aa  140  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  46.83 
 
 		 131 aa  137  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  53.85 
 
 		 125 aa  137  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  55.56 
 
 		 124 aa  136  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.7 
 
 		 124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  55.56 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  52.99 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  52.54 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  47.24 
 
 		 150 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.14 
 
 		 145 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.62 
 
 		 138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  51.28 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.43 
 
 		 142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  50.43 
 
 		 144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  50.85 
 
 		 143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  50.43 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  50.85 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0021  NifU-like protein  53.78 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.13876e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  49.57 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  47.41 
 
 		 129 aa  120  9e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.88 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.9 
 
 		 207 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.01 
 
 		 278 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.33 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  48.28 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.15 
 
 		 286 aa  118  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  41.67 
 
 		 137 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  47.01 
 
 		 173 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.92 
 
 		 283 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.31 
 
 		 284 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.31 
 
 		 284 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.06 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1928  NifU domain-containing protein  39.52 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.46543  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  50 
 
 		 281 aa  114  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.53 
 
 		 291 aa  114  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  44.53 
 
 		 291 aa  114  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.09 
 
 		 298 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  46.22 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.46 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  48.31 
 
 		 312 aa  111  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.53 
 
 		 284 aa  110  8.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.86 
 
 		 281 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1947  NifU domain-containing protein  40.52 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  44.62 
 
 		 133 aa  106  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2204  scaffold protein  46.67 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00285299  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.76 
 
 		 277 aa  105  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  49.57 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.86 
 
 		 280 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  47.5 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1026  scaffold protein  43.85 
 
 		 133 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00834233  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  47.5 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  45.24 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1325  scaffold protein  48.33 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  45.24 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.31 
 
 		 286 aa  103  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  46.67 
 
 		 135 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  45 
 
 		 143 aa  103  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  48.08 
 
 		 125 aa  103  9e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  45 
 
 		 143 aa  103  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  42.96 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2148  scaffold protein  47.5 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245787  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  48.31 
 
 		 285 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1962  scaffold protein  47.5 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0186056  hitchhiker  0.00197009 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  45.08 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  45.83 
 
 		 133 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  45.83 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2265  scaffold protein  47.5 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2396  scaffold protein  47.5 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1059  scaffold protein  43.08 
 
 		 133 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2501  scaffold protein  47.5 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0368834  normal  0.021811 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  45.6 
 
 		 135 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2385  scaffold protein  47.5 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000223926  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  45.6 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1239  scaffold protein  45.83 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1740  scaffold protein  47.5 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1820  scaffold protein  47.5 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00411311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2279  scaffold protein  47.5 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0078288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  45.83 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  45 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  47.86 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.37 
 
 		 309 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2142  scaffold protein  44 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  40.77 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  45 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0653  NifU domain-containing protein  41.03 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000132683  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5952  scaffold protein  44 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.31 
 
 		 290 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2125  scaffold protein  44 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  46.72 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5431  scaffold protein  44.8 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  44.8 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1443  scaffold protein  44.26 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0899521  normal  0.0121231 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  45 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  44.8 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  44.72 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  45 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>