More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1913 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  100 
 
 		 147 aa  300  5.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  54.61 
 
 		 144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  59.44 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  59.52 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  59.85 
 
 		 150 aa  168  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  57.04 
 
 		 143 aa  166  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  56.69 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  56.69 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  60.48 
 
 		 129 aa  164  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  60.8 
 
 		 149 aa  163  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  57.02 
 
 		 127 aa  157  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  57.63 
 
 		 122 aa  150  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  56.67 
 
 		 125 aa  150  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  55.28 
 
 		 123 aa  150  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.29 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  56.67 
 
 		 124 aa  146  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  55 
 
 		 138 aa  146  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.55 
 
 		 124 aa  144  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.3 
 
 		 284 aa  143  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.3 
 
 		 284 aa  143  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  53.72 
 
 		 137 aa  143  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.55 
 
 		 281 aa  141  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.4 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.62 
 
 		 286 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  59.35 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1562  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.54 
 
 		 137 aa  135  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.43451 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.1 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.78 
 
 		 344 aa  135  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  50.83 
 
 		 129 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  50 
 
 		 173 aa  134  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.26 
 
 		 284 aa  133  8e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  49.59 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.2 
 
 		 300 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.13 
 
 		 280 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.4 
 
 		 296 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  53.39 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.18 
 
 		 283 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  48.51 
 
 		 291 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.51 
 
 		 291 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  47.76 
 
 		 312 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.8 
 
 		 306 aa  127  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.88 
 
 		 281 aa  128  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  56 
 
 		 288 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.69 
 
 		 278 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0409  scaffold protein  50 
 
 		 138 aa  127  6e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  48 
 
 		 309 aa  127  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  56.3 
 
 		 285 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.3 
 
 		 286 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.27 
 
 		 298 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0630  scaffold protein  48.8 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.58 
 
 		 309 aa  125  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  46.88 
 
 		 153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  48.39 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  48.44 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.01 
 
 		 329 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.58 
 
 		 277 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0619  scaffold protein  47.66 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0628  scaffold protein  47.66 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.69 
 
 		 207 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.46 
 
 		 290 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  46.77 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  46.77 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  48.39 
 
 		 128 aa  124  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  47.24 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2501  scaffold protein  47.2 
 
 		 127 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0368834  normal  0.021811 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2148  scaffold protein  47.2 
 
 		 127 aa  123  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245787  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2385  scaffold protein  47.2 
 
 		 127 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000223926  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1962  scaffold protein  47.2 
 
 		 127 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0186056  hitchhiker  0.00197009 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2396  scaffold protein  47.2 
 
 		 127 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0889  scaffold protein  46.77 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112954  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2265  scaffold protein  47.2 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0236  IscU protein  45.39 
 
 		 203 aa  122  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  47.5 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1740  scaffold protein  47.2 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1820  scaffold protein  47.2 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00411311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2279  scaffold protein  47.2 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0078288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.72 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  48.41 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  46.77 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  48.39 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  46.77 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  48.39 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  48.39 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  48.39 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.97 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  49.6 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  48.39 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  48.41 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  50 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  47.2 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2904  scaffold protein  47.58 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146516  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  51.2 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  45.97 
 
 		 211 aa  121  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1105  FeS cluster assembly scaffold IscU  47.2 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  47.2 
 
 		 137 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1459  scaffold protein  45.16 
 
 		 127 aa  120  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0275409  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2423  scaffold protein  45.6 
 
 		 127 aa  120  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.72 
 
 		 153 aa  121  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  47.58 
 
 		 128 aa  120  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  47.58 
 
 		 128 aa  120  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>