More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2605 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2605  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 153 aa  313  6e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000897774  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  58.27 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2443  NifU-like protein  54.62 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1928  NifU domain-containing protein  50.39 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.46543  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  52.54 
 
 		 125 aa  132  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.69 
 
 		 138 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  51.72 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  50.83 
 
 		 139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  51.72 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  48.41 
 
 		 173 aa  122  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  48 
 
 		 150 aa  120  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  50 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  46.55 
 
 		 145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  47.41 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  46.55 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  46.55 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  47.41 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  48.28 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1947  NifU domain-containing protein  47.5 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  46.55 
 
 		 137 aa  115  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  44.83 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  44.72 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  47.41 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.43 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  47.06 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  40.44 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  51.46 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.52 
 
 		 286 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  47.97 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.45 
 
 		 154 aa  110  6e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.15 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.52 
 
 		 283 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.67 
 
 		 284 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.67 
 
 		 284 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  46.61 
 
 		 291 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.61 
 
 		 291 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0021  NifU-like protein  44.53 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.13876e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  46.6 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.02 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.7 
 
 		 207 aa  100  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  42.74 
 
 		 137 aa  100  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.3 
 
 		 281 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.01 
 
 		 280 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  42.64 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.06 
 
 		 278 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  45.08 
 
 		 128 aa  98.6  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2423  scaffold protein  45.9 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  44.26 
 
 		 128 aa  98.2  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  44.26 
 
 		 128 aa  98.2  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  42.54 
 
 		 182 aa  98.2  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  45.9 
 
 		 127 aa  97.8  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  46.72 
 
 		 127 aa  97.8  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  45.83 
 
 		 135 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  44.07 
 
 		 211 aa  97.1  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  45.83 
 
 		 135 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1105  FeS cluster assembly scaffold IscU  43.44 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  45.08 
 
 		 127 aa  96.7  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  45 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  45.83 
 
 		 135 aa  96.7  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0282  scaffold protein  43.44 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.3 
 
 		 281 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  44.26 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  44.26 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  44.26 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  44.8 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.45 
 
 		 288 aa  95.5  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  44.26 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  48.28 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  44.26 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.3 
 
 		 284 aa  95.9  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.76 
 
 		 286 aa  95.9  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  44.26 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  44.26 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  44.26 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0653  NifU domain-containing protein  41.38 
 
 		 163 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000132683  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2142  scaffold protein  45 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2654  scaffold protein  45 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3104  scaffold protein  45 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1707  scaffold protein  45 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1488  scaffold protein  45 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.719074  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  44.26 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  44.26 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2732  scaffold protein  45 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5431  scaffold protein  45 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2598  scaffold protein  45 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662204  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2216  scaffold protein  45 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  44.26 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  43.44 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  43.22 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  42.42 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  44.26 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  44.26 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5952  scaffold protein  45 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2125  scaffold protein  45 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  43.33 
 
 		 133 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1325  scaffold protein  42.62 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  43.33 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.68 
 
 		 277 aa  94.4  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.18 
 
 		 309 aa  94.4  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>