160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_49030 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_49030  NifU C-terminal domain-containing protein, AnfU  100 
 
 		 96 aa  190  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02790  NifU C-terminal domain-containing protein, VnfU  55.07 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1256  NifU domain-containing protein  48.1 
 
 		 241 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0531  nitrogen fixation protein  42.86 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.035039  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2183  NifU domain-containing protein  42.86 
 
 		 246 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260417 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  39.08 
 
 		 291 aa  67.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.08 
 
 		 291 aa  67.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0107  NifU domain-containing protein  44.16 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.826994 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.83 
 
 		 328 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.44 
 
 		 329 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  46.48 
 
 		 333 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0484  NifU domain-containing protein  42.31 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.44 
 
 		 298 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.08 
 
 		 283 aa  61.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.74 
 
 		 286 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0330  nitrogen-fixing NifU-like protein  34.18 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  43.48 
 
 		 338 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5908  putative nifU protein  42.86 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  41.67 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.96 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.74 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.28 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.67 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1782  NifU family protein  35.44 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  39.19 
 
 		 312 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  35.29 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.96 
 
 		 290 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.19 
 
 		 284 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.21 
 
 		 277 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.76 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2270  nitrogen-fixing NifU-like  40.54 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.228591  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.56 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1004  NifU family protein  43.08 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0012863  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.76 
 
 		 296 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  46.38 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  47.69 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.69 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.71 
 
 		 278 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.66 
 
 		 309 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  47.76 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.85 
 
 		 277 aa  53.9  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  46.43 
 
 		 213 aa  53.5  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1742  hypothetical protein  35.44 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0211624  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  45.45 
 
 		 81 aa  52  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  48.94 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  47.54 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.37 
 
 		 300 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  46.15 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  47.54 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.68 
 
 		 306 aa  51.2  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0061  NifU family protein  40 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.269629  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  43.64 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.12 
 
 		 73 aa  50.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  47.54 
 
 		 74 aa  50.4  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.27 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.37 
 
 		 281 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  48.39 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  45.45 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  50 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  45.45 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  43.94 
 
 		 242 aa  49.7  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  45.83 
 
 		 254 aa  50.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  45.45 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.45 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  46.15 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.45 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.86 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  43.28 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  43.28 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  43.28 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  43.28 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  43.28 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  43.28 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  43.28 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9865  predicted protein  39.34 
 
 		 73 aa  49.7  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.07223  normal  0.100166 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  43.28 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  46.43 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  43.28 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  43.28 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.37 
 
 		 281 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.67 
 
 		 276 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  40 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.29 
 
 		 294 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.29 
 
 		 294 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.46 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.24 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1483  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.35 
 
 		 281 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.530906  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.84 
 
 		 293 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  46.15 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1875  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.64 
 
 		 299 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12597  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  47.27 
 
 		 80 aa  47.4  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4477  HesB/YadR/YfhF  38.36 
 
 		 206 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0747916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.71 
 
 		 291 aa  47.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  40.62 
 
 		 72 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1492  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.6 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0512001  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  36.51 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.37 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  45.45 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  47.37 
 
 		 73 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>