196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2270 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2270  nitrogen-fixing NifU-like  100 
 
 		 99 aa  199  8e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.228591  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0484  NifU domain-containing protein  61.19 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0531  nitrogen fixation protein  55.56 
 
 		 246 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.035039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.71 
 
 		 328 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  58.21 
 
 		 333 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2183  NifU domain-containing protein  55.56 
 
 		 246 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260417 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1256  NifU domain-containing protein  58.21 
 
 		 241 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  55.22 
 
 		 331 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  52.05 
 
 		 312 aa  83.6  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.71 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.35 
 
 		 298 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.45 
 
 		 344 aa  79  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.93 
 
 		 329 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0107  NifU domain-containing protein  51.95 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.826994 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  54.24 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.38 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  46.38 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5908  putative nifU protein  52.54 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  40 
 
 		 277 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02790  NifU C-terminal domain-containing protein, VnfU  47.06 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.61 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49030  NifU C-terminal domain-containing protein, AnfU  40.54 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.85 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.43 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  46.38 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00755  NifU protein, putative  49.21 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0945933  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  45 
 
 		 283 aa  53.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  41.38 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.83 
 
 		 77 aa  52  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.72 
 
 		 87 aa  52  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  39.24 
 
 		 291 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  41.67 
 
 		 326 aa  51.6  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  44.93 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  44.93 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  53.66 
 
 		 72 aa  51.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  44.93 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  44.93 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  44.93 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  44.93 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  44.93 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  44.93 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  48.08 
 
 		 289 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  44.93 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  44.93 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.24 
 
 		 277 aa  51.6  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.94 
 
 		 78 aa  50.8  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.92 
 
 		 286 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.45 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.54 
 
 		 288 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  42.19 
 
 		 195 aa  50.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  38.81 
 
 		 188 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  37.68 
 
 		 188 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  37.68 
 
 		 188 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  46.3 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  40 
 
 		 284 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  45.16 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  45.07 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  41.67 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.91 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.33 
 
 		 293 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.81 
 
 		 285 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  46.55 
 
 		 254 aa  49.7  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.75 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  48.39 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  40 
 
 		 284 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  40 
 
 		 190 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  34.33 
 
 		 201 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.91 
 
 		 281 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  45 
 
 		 280 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  40 
 
 		 190 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.06 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  45.31 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  40 
 
 		 190 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  41.33 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  48.39 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1483  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.26 
 
 		 281 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.530906  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  49.18 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  39.29 
 
 		 190 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.37 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  41.33 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0330  nitrogen-fixing NifU-like protein  37.29 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2358  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.33 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  38.6 
 
 		 183 aa  47.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  37.5 
 
 		 191 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  40 
 
 		 276 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.94 
 
 		 281 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  37.1 
 
 		 186 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  36.92 
 
 		 285 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  40 
 
 		 290 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  47.54 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  47.54 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.71 
 
 		 309 aa  47  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  45.31 
 
 		 206 aa  47  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  46.77 
 
 		 73 aa  47.4  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0419  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.33 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.68 
 
 		 183 aa  47  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1782  NifU family protein  44.9 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  45.9 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0128  NifU domain protein  44.26 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.202734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  35.29 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>