More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1256 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1256  NifU domain-containing protein  100 
 
 		 241 aa  471  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2183  NifU domain-containing protein  73.98 
 
 		 246 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260417 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0531  nitrogen fixation protein  73.98 
 
 		 246 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.035039  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  31.23 
 
 		 291 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.23 
 
 		 291 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  32 
 
 		 277 aa  131  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.45 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.07 
 
 		 278 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.32 
 
 		 344 aa  106  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  29.7 
 
 		 283 aa  105  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.82 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.4 
 
 		 281 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.11 
 
 		 281 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  26.18 
 
 		 277 aa  99.4  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  27.76 
 
 		 286 aa  98.6  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  43.85 
 
 		 312 aa  98.6  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  29.47 
 
 		 288 aa  98.6  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.27 
 
 		 298 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.73 
 
 		 329 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  28.11 
 
 		 284 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  27.76 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  40.5 
 
 		 333 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  29.3 
 
 		 276 aa  87  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  28.83 
 
 		 286 aa  86.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2270  nitrogen-fixing NifU-like  58.21 
 
 		 99 aa  86.7  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.228591  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  38.33 
 
 		 125 aa  86.3  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  55.71 
 
 		 331 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0484  NifU domain-containing protein  57.35 
 
 		 106 aa  84.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.01 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.02 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  41.9 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.83 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  27.62 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.76 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  34.43 
 
 		 124 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  37.07 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  41.67 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  36.29 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  36.29 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  33.59 
 
 		 149 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49030  NifU C-terminal domain-containing protein, AnfU  48.1 
 
 		 96 aa  77.8  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  35.04 
 
 		 122 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  42.55 
 
 		 143 aa  77.4  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  35.29 
 
 		 124 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.09 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5908  putative nifU protein  46.15 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  40.43 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.98 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0107  NifU domain-containing protein  50.75 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.826994 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.61 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  36.97 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.45 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  42.55 
 
 		 144 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  31.9 
 
 		 123 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.59 
 
 		 154 aa  73.9  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.88 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  40.52 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  36.59 
 
 		 285 aa  72  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  37.23 
 
 		 145 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  38.3 
 
 		 143 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.58 
 
 		 153 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  35.04 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  37.82 
 
 		 147 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1947  NifU domain-containing protein  33.33 
 
 		 133 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  31.09 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  31.03 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  30 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  33.86 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02790  NifU C-terminal domain-containing protein, VnfU  44.59 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2443  NifU-like protein  32.28 
 
 		 128 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.38 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  32.52 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.38 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.9 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1325  scaffold protein  31.97 
 
 		 128 aa  62  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2605  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.21 
 
 		 153 aa  62  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000897774  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  38.3 
 
 		 129 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  31.71 
 
 		 134 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.28 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.85 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0869  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.91 
 
 		 134 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0951  NifU domain-containing protein  26.23 
 
 		 127 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0835  NifU domain-containing protein  26.67 
 
 		 127 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_822  NifU domain protein  26.23 
 
 		 127 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1928  NifU domain-containing protein  38.74 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.46543  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  38.37 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0653  NifU domain-containing protein  31.36 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000132683  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  29.31 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  29.51 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  30.85 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  37.35 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1568  scaffold protein  31.97 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.497766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  37.21 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  35.63 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  37.21 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0889  scaffold protein  36.71 
 
 		 127 aa  58.2  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112954  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  28.69 
 
 		 127 aa  58.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1277  scaffold protein  33.72 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0307655  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0434  scaffold protein  33.72 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163571 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1169  scaffold protein  33.72 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.310149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>