More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0951 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0951  NifU domain-containing protein  100 
 
 		 127 aa  266  1e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_822  NifU domain protein  95.28 
 
 		 127 aa  256  7e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0835  NifU domain-containing protein  93.7 
 
 		 127 aa  250  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  52.5 
 
 		 125 aa  144  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  50.42 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.83 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  51.67 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  53.33 
 
 		 123 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  48.39 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  48.76 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  50 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  50.42 
 
 		 129 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  46.67 
 
 		 144 aa  133  9e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  48.8 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.67 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.83 
 
 		 124 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  47.41 
 
 		 150 aa  130  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  46.67 
 
 		 173 aa  130  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  45.45 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  47.5 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  47.5 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  51.69 
 
 		 137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  46.67 
 
 		 143 aa  127  6e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  48.33 
 
 		 153 aa  124  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  45 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  45 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  44.53 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.09 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.55 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  41.53 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.62 
 
 		 277 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.8 
 
 		 284 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.8 
 
 		 286 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.8 
 
 		 284 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.62 
 
 		 284 aa  112  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  48.08 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.8 
 
 		 309 aa  110  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  43.2 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  42.4 
 
 		 211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  40 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.71 
 
 		 291 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.46 
 
 		 280 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  38.71 
 
 		 291 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.9 
 
 		 283 aa  105  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.73 
 
 		 281 aa  102  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  43.31 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0653  NifU domain-containing protein  43.97 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000132683  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  43.31 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  43.31 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  43.31 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  43.31 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  43.31 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  43.31 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  43.31 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  43.31 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  43.31 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  43.31 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  43.31 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  43.31 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  43.31 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.98 
 
 		 276 aa  101  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  42.97 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  43.9 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.7 
 
 		 281 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  43.31 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.9 
 
 		 298 aa  100  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  38.71 
 
 		 312 aa  100  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2904  scaffold protein  43.31 
 
 		 128 aa  100  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146516  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.59 
 
 		 278 aa  100  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  42.52 
 
 		 128 aa  100  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  43.9 
 
 		 128 aa  99.4  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1165  scaffold protein  43.09 
 
 		 128 aa  99.4  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0089491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1325  scaffold protein  43.09 
 
 		 128 aa  99.4  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  40.16 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  40 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.98 
 
 		 286 aa  98.2  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  42.52 
 
 		 128 aa  98.2  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  42.52 
 
 		 128 aa  98.2  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  42.28 
 
 		 135 aa  97.8  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.5 
 
 		 306 aa  97.4  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  41.41 
 
 		 182 aa  97.8  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0282  scaffold protein  41.46 
 
 		 127 aa  97.8  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4611  scaffold protein  43.9 
 
 		 128 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3626  scaffold protein  41.73 
 
 		 128 aa  97.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.284747  normal  0.811196 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  33.06 
 
 		 131 aa  97.1  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0885  scaffold protein  41.46 
 
 		 133 aa  97.1  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  41.46 
 
 		 133 aa  97.1  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.1 
 
 		 329 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  40.83 
 
 		 129 aa  96.7  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0207  IscU protein  40.8 
 
 		 203 aa  96.7  9e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  41.46 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  41.46 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  41.46 
 
 		 133 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.4 
 
 		 281 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  41.46 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01056  scaffold protein  42.4 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  41.46 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  43.9 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0843  scaffold protein  43.09 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1424  iron-binding protein IscU  43.09 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>