176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0484 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0484  NifU domain-containing protein  100 
 
 		 106 aa  213  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  63.77 
 
 		 328 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  60.87 
 
 		 333 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0107  NifU domain-containing protein  59.46 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.826994 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  55.41 
 
 		 331 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  58.33 
 
 		 312 aa  94.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  54.29 
 
 		 338 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2270  nitrogen-fixing NifU-like  61.19 
 
 		 99 aa  90.5  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.228591  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  62.32 
 
 		 344 aa  90.5  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5908  putative nifU protein  48.61 
 
 		 96 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.34 
 
 		 329 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0531  nitrogen fixation protein  57.35 
 
 		 246 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.035039  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2183  NifU domain-containing protein  57.35 
 
 		 246 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260417 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1256  NifU domain-containing protein  57.35 
 
 		 241 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  50 
 
 		 298 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.64 
 
 		 309 aa  81.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.44 
 
 		 277 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.71 
 
 		 291 aa  73.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  45.71 
 
 		 291 aa  73.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02790  NifU C-terminal domain-containing protein, VnfU  41.86 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49030  NifU C-terminal domain-containing protein, AnfU  42.31 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  52.94 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.79 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  53.12 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.91 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.67 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.84 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.06 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.95 
 
 		 280 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.23 
 
 		 309 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  41.67 
 
 		 73 aa  53.5  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  44.44 
 
 		 285 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00755  NifU protein, putative  44.44 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0945933  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.46 
 
 		 286 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.78 
 
 		 288 aa  52.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.74 
 
 		 281 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  44.83 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  44 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0994  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.54 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.18 
 
 		 284 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.18 
 
 		 284 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  44.62 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  44.62 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  41.94 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1302  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.93 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0063306  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.03 
 
 		 294 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.03 
 
 		 294 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  43.08 
 
 		 80 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.21 
 
 		 281 aa  50.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  41.94 
 
 		 89 aa  50.8  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.9 
 
 		 286 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.44 
 
 		 72 aa  50.1  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  35 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.24 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.21 
 
 		 290 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2153  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.33 
 
 		 329 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  37.04 
 
 		 213 aa  49.7  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1782  NifU family protein  41.82 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0330  nitrogen-fixing NifU-like protein  41.82 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2358  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.32 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  41.94 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213209  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  41.18 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  43.48 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.03 
 
 		 277 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.76 
 
 		 286 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4477  HesB/YadR/YfhF  37.23 
 
 		 206 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0747916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0419  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.94 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.94 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.68 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.39 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.39 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.98 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  41.51 
 
 		 311 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.08 
 
 		 291 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.86 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1875  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.47 
 
 		 299 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.54 
 
 		 281 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.9 
 
 		 73 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.33 
 
 		 278 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.18 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  36.36 
 
 		 291 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  40.58 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.16 
 
 		 296 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.33 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  36.92 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0290  NifU family protein  40.91 
 
 		 323 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  36.92 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  36.92 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  36.92 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.76 
 
 		 306 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  36.92 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  36.92 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0299  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.43 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120808 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0264  NifU family protein  40.91 
 
 		 323 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  36.92 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1487  NifU-like protein  31.07 
 
 		 323 aa  46.6  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  36.92 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  36.92 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.89 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>