210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1302 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1302  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 84 aa  172  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0063306  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0402  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.75 
 
 		 83 aa  70.1  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.280391  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  50 
 
 		 74 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.66 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.59 
 
 		 73 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  48.53 
 
 		 74 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.12 
 
 		 73 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  41.54 
 
 		 72 aa  63.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  47.06 
 
 		 73 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  44.93 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.54 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.81 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  40 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  38.81 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  42.03 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  41.54 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  41.54 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  41.54 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  41.54 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  41.54 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  38.81 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  41.54 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  41.54 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  41.54 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  41.54 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  41.54 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  41.94 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.18 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  41.54 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  41.18 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.65 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  37.31 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.46 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.25 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.46 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0925  hypothetical protein  39.39 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0198354 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.48 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  38.46 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  39.71 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.86 
 
 		 73 aa  57  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.58 
 
 		 73 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.03 
 
 		 309 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  32.91 
 
 		 296 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00755  NifU protein, putative  43.94 
 
 		 80 aa  57  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0945933  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.91 
 
 		 301 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  35.82 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  40 
 
 		 74 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.02 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.06 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  35.82 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9865  predicted protein  50 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.07223  normal  0.100166 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  38.36 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1632  NifU-like protein  46.27 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000186996  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  36.92 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  34.33 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3360  nitrogen-fixing NifU-like  42.03 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.595792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  35.29 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  34.33 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  34.33 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  39.19 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  34.33 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  39.68 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.3 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  38.1 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  38.1 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  34.33 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  35.71 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  37.68 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4936  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.33 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0330  nitrogen-fixing NifU-like protein  33.75 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.18 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  37.68 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.68 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.82 
 
 		 283 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.06 
 
 		 281 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1109  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.36 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2324  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.78 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.575512  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0484  NifU domain-containing protein  37.93 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2009  hypothetical protein  38.1 
 
 		 203 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.98 
 
 		 278 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  32.84 
 
 		 186 aa  50.8  0.000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1514  NifU domain protein  46.27 
 
 		 72 aa  50.4  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120627  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.06 
 
 		 289 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  38.71 
 
 		 201 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  32.35 
 
 		 190 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  32.84 
 
 		 186 aa  49.7  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.06 
 
 		 289 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.59 
 
 		 280 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  32.35 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.68 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  34.78 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1377  NifU domain-containing protein  44.78 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000465416  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  33.33 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  32.35 
 
 		 190 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2142  nitrogen-fixing NifU-like protein  28.38 
 
 		 294 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  34.85 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0047  nitrogen-fixing NifU domain protein  36 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46593  predicted protein  35.38 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.78436  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1326  NifU domain-containing protein  40.32 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5908  putative nifU protein  30.56 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674127  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>