175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0402 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0402  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 83 aa  170  5.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.280391  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1302  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.75 
 
 		 84 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0063306  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  38.36 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  30.88 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  28.95 
 
 		 289 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  33.82 
 
 		 73 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.24 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  37.68 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.57 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.24 
 
 		 73 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  36.23 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.99 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0925  hypothetical protein  37.68 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0198354 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  36.76 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  33.82 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  35.29 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.4 
 
 		 285 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  37.29 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4600  nitrogen-fixing NifU-like  36.07 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  36.76 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  36.23 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4936  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.17 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40630  hypothetical protein  42.86 
 
 		 194 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3445  hypothetical protein  42.86 
 
 		 194 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4010  putative DNA uptake protein  36.99 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3528  putative DNA uptake protein  37.84 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.81 
 
 		 289 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.81 
 
 		 289 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  30.88 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.14 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0179  putative DNA uptake protein  41.27 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1632  NifU-like protein  42.65 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000186996  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.19 
 
 		 309 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0159  putative DNA uptake protein  38.03 
 
 		 192 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3202  putative DNA uptake protein  33.78 
 
 		 193 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0161749 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.43 
 
 		 73 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  24.66 
 
 		 286 aa  47.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.82 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.76 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0106  putative DNA uptake protein  35.62 
 
 		 192 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.790621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  33.33 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1492  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.43 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0512001  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.72 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.43 
 
 		 73 aa  47  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.88 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3880  putative DNA uptake protein  36.99 
 
 		 192 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3502  putative DNA uptake protein  40.35 
 
 		 192 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.840353  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  30.56 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  30.14 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3804  putative DNA uptake protein  36.99 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.472358 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4125  putative DNA uptake protein  36.49 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4003  putative DNA uptake protein  36.99 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.860921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1109  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.86 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0142  putative DNA uptake protein  36.49 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3794  putative DNA uptake protein  35.14 
 
 		 192 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100459  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  29.17 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  29.17 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4192  putative DNA uptake protein  36.49 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  32.35 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4324  putative DNA uptake protein  36.49 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0691  NifU-related protein  33.33 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000306836 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4619  putative DNA uptake protein  35.14 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  30.14 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  28.17 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.57 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3360  nitrogen-fixing NifU-like  30.3 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.595792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2324  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.78 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.575512  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  29.17 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.33 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0244  putative DNA uptake protein  40.35 
 
 		 192 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2293  putative DNA uptake protein  34.72 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1514  NifU domain protein  44.12 
 
 		 72 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120627  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28760  NfuA protein  38.78 
 
 		 194 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1888  HesB/YadR/YfhF  33.33 
 
 		 196 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.82 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3827  putative DNA uptake protein  34.25 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.82 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4119  putative DNA uptake protein  34.25 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03266  predicted gluconate transport associated protein  34.25 
 
 		 191 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00179798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0299  IscR-regulated protein YhgI  34.25 
 
 		 191 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044435  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  29.17 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3795  putative DNA uptake protein  34.25 
 
 		 191 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4721  putative DNA uptake protein  34.25 
 
 		 191 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1377  NifU domain-containing protein  42.65 
 
 		 72 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000465416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3611  putative DNA uptake protein  34.25 
 
 		 191 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3889  putative DNA uptake protein  34.25 
 
 		 191 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.09 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03218  hypothetical protein  34.25 
 
 		 191 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00164281  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0299  putative DNA uptake protein  34.25 
 
 		 191 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00815707  normal  0.0446785 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3695  putative DNA uptake protein  34.25 
 
 		 191 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.33 
 
 		 298 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  29.58 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4634  putative DNA uptake protein  34.25 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.33 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1491  putative DNA uptake protein  36.67 
 
 		 193 aa  43.9  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  29.63 
 
 		 312 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3926  putative DNA uptake protein  34.25 
 
 		 191 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  32.89 
 
 		 187 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  29.09 
 
 		 338 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  26.87 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>