148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0691 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0691  NifU-related protein  100 
 
 		 94 aa  192  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000306836 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  40 
 
 		 281 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1525  HesB/YadR/YfhF-family protein  42.62 
 
 		 195 aa  50.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2142  nitrogen-fixing NifU-like protein  31.71 
 
 		 294 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2188  NifU domain-containing protein  31.71 
 
 		 294 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226918 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  35.71 
 
 		 188 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  30.16 
 
 		 190 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  28.57 
 
 		 188 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.67 
 
 		 285 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  28.57 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2129  NifU domain-containing protein  30.49 
 
 		 294 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0750308  normal  0.014165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  28.57 
 
 		 188 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  25.4 
 
 		 188 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  31.25 
 
 		 190 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1070  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.46 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.23 
 
 		 281 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  31.25 
 
 		 190 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  31.34 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.92 
 
 		 280 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  30.77 
 
 		 254 aa  46.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1782  NifU family protein  37.1 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  33.93 
 
 		 191 aa  45.4  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.59 
 
 		 309 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  30.36 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0402  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.33 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.280391  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  25.4 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  38.46 
 
 		 289 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  30.36 
 
 		 188 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0107  NifU domain-containing protein  46.67 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.826994 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.91 
 
 		 290 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  30.36 
 
 		 186 aa  45.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2542  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.38 
 
 		 306 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1911  hypothetical protein  31.82 
 
 		 227 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000392795  hitchhiker  0.00108913 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  33.82 
 
 		 186 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  30.77 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  28.81 
 
 		 201 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  33.33 
 
 		 291 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  30.36 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  30.36 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  30.36 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.25 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  27.12 
 
 		 183 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2202  HesB/YadR/YfhF  31.82 
 
 		 257 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.20209  decreased coverage  0.00866489 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1326  NifU domain-containing protein  40.91 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.82 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00755  NifU protein, putative  40.74 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0945933  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.33 
 
 		 286 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2988  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.2 
 
 		 202 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9865  predicted protein  28.57 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.07223  normal  0.100166 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  28.81 
 
 		 188 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  25.4 
 
 		 191 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1723  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.99 
 
 		 204 aa  44.3  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  26.79 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  33.85 
 
 		 187 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  32.69 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  27.12 
 
 		 187 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  27.12 
 
 		 187 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  34.33 
 
 		 81 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2009  hypothetical protein  32.26 
 
 		 203 aa  43.5  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  34.33 
 
 		 81 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  25.84 
 
 		 326 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  25.4 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  34.33 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  31.75 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  31.34 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  34.33 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.94 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.42 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  43.14 
 
 		 289 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  34.33 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  34.33 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  34.33 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  34.33 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.83 
 
 		 309 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5908  putative nifU protein  38.98 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2344  HesB/YadR/YfhF-family protein  35.48 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0112883 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.55 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  22.58 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1888  HesB/YadR/YfhF  35.48 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  27.42 
 
 		 190 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.79 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.62 
 
 		 344 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  38.3 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.9 
 
 		 276 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  27.54 
 
 		 242 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.59 
 
 		 289 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1847  HesB/YadR/YfhF-family protein  30.3 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000308783 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.85 
 
 		 278 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.59 
 
 		 289 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.89 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.33 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3926  putative DNA uptake protein  32.31 
 
 		 191 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.77 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  23.21 
 
 		 195 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3528  putative DNA uptake protein  31.75 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1491  putative DNA uptake protein  30.3 
 
 		 193 aa  41.2  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241637  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  33.96 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  32.84 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  32.76 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0159  putative DNA uptake protein  30.16 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>