249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1491 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1491  putative DNA uptake protein  100 
 
 		 193 aa  402  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241637  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001879  NfuA Fe-S protein maturation  76.56 
 
 		 194 aa  318  3.9999999999999996e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00614  putative DNA uptake protein  76.56 
 
 		 194 aa  317  6e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2911  putative DNA uptake protein  74.87 
 
 		 194 aa  313  8e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03266  predicted gluconate transport associated protein  74.35 
 
 		 191 aa  309  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00179798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0299  IscR-regulated protein YhgI  74.35 
 
 		 191 aa  309  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044435  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0299  putative DNA uptake protein  74.35 
 
 		 191 aa  309  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00815707  normal  0.0446785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4721  putative DNA uptake protein  74.35 
 
 		 191 aa  309  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3795  putative DNA uptake protein  74.35 
 
 		 191 aa  309  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03218  hypothetical protein  74.35 
 
 		 191 aa  309  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00164281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3695  putative DNA uptake protein  74.35 
 
 		 191 aa  309  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3889  putative DNA uptake protein  74.35 
 
 		 191 aa  309  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3611  putative DNA uptake protein  74.35 
 
 		 191 aa  309  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3881  putative DNA uptake protein  74.35 
 
 		 191 aa  309  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3819  putative DNA uptake protein  74.35 
 
 		 191 aa  309  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3713  putative DNA uptake protein  74.35 
 
 		 191 aa  309  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3710  putative DNA uptake protein  74.35 
 
 		 191 aa  309  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.238496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3785  putative DNA uptake protein  74.35 
 
 		 191 aa  309  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2293  putative DNA uptake protein  73.82 
 
 		 195 aa  308  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3750  putative DNA uptake protein  72.25 
 
 		 191 aa  305  3e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0163  putative DNA uptake protein  72.25 
 
 		 191 aa  305  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3990  putative DNA uptake protein  72.25 
 
 		 191 aa  305  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3827  putative DNA uptake protein  72.25 
 
 		 191 aa  305  3e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0316  putative DNA uptake protein  71.2 
 
 		 191 aa  302  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0234  putative DNA uptake protein  71.73 
 
 		 191 aa  301  4.0000000000000003e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4119  putative DNA uptake protein  71.73 
 
 		 191 aa  301  5.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3926  putative DNA uptake protein  71.73 
 
 		 191 aa  300  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4634  putative DNA uptake protein  71.73 
 
 		 191 aa  299  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4192  putative DNA uptake protein  71.58 
 
 		 192 aa  297  7e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4324  putative DNA uptake protein  71.58 
 
 		 192 aa  297  7e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4125  putative DNA uptake protein  71.58 
 
 		 192 aa  297  7e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0142  putative DNA uptake protein  71.58 
 
 		 192 aa  297  7e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03996  putative DNA uptake protein  70.68 
 
 		 192 aa  296  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4010  putative DNA uptake protein  72.63 
 
 		 192 aa  296  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0159  putative DNA uptake protein  72.11 
 
 		 192 aa  293  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4619  putative DNA uptake protein  70.53 
 
 		 192 aa  292  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3880  putative DNA uptake protein  70.53 
 
 		 192 aa  292  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0106  putative DNA uptake protein  71.58 
 
 		 192 aa  290  6e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.790621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3794  putative DNA uptake protein  69.47 
 
 		 192 aa  290  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100459  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3804  putative DNA uptake protein  70 
 
 		 192 aa  289  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.472358 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4003  putative DNA uptake protein  70 
 
 		 192 aa  289  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.860921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4233  putative DNA uptake protein  69.11 
 
 		 192 aa  288  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3502  putative DNA uptake protein  70 
 
 		 192 aa  287  6e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.840353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0179  putative DNA uptake protein  70 
 
 		 192 aa  287  7e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0244  putative DNA uptake protein  68.95 
 
 		 192 aa  286  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0220  putative DNA uptake protein  68.59 
 
 		 192 aa  282  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.722098  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3528  putative DNA uptake protein  65.79 
 
 		 192 aa  280  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3202  putative DNA uptake protein  64.92 
 
 		 193 aa  273  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0161749 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3445  hypothetical protein  51.56 
 
 		 194 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40630  hypothetical protein  51.56 
 
 		 194 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1525  HesB/YadR/YfhF-family protein  48.44 
 
 		 195 aa  206  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0484  yhgI protein  49.21 
 
 		 190 aa  203  1e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.508791  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28760  NfuA protein  49.74 
 
 		 194 aa  194  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1911  hypothetical protein  48.47 
 
 		 227 aa  184  8e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000392795  hitchhiker  0.00108913 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2202  HesB/YadR/YfhF  48.47 
 
 		 257 aa  184  8e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.20209  decreased coverage  0.00866489 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2009  hypothetical protein  43.3 
 
 		 203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2161  HesB/YadR/YfhF-family protein  49.48 
 
 		 194 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.0420771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1891  IscR-regulated protein YhgI  49.48 
 
 		 194 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1888  HesB/YadR/YfhF  44.79 
 
 		 196 aa  181  8.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2378  yhgI protein  49.48 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0102502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1985  IscR-regulated protein YhgI  49.48 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.858904  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3317  HesB/YadR/YfhF-family protein  49.48 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0770851 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2344  HesB/YadR/YfhF-family protein  44.56 
 
 		 193 aa  178  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0112883 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1847  HesB/YadR/YfhF-family protein  45.92 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000308783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3104  HesB/YadR/YfhF  48.44 
 
 		 194 aa  171  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2735  yhgI protein  47.69 
 
 		 197 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2466  HesB/YadR/YfhF:nitrogen-fixing NifU, C-terminal  47.69 
 
 		 197 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0790017  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01524  protein GntY  38.54 
 
 		 199 aa  155  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2673  HesB/YadR/YfhF-family protein  39.06 
 
 		 199 aa  154  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114695 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2172  thioredoxin-like protein  37.5 
 
 		 199 aa  147  8e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2084  HesB/YadR/YfhF-family protein  37.95 
 
 		 199 aa  147  8e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.92431  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2457  HesB/YadR/YfhF-family protein  39.69 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0172331  normal  0.307716 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1723  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.33 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.11 
 
 		 87 aa  57.8  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  30.21 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  42.86 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.54 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  40.98 
 
 		 296 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.98 
 
 		 301 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1109  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.71 
 
 		 88 aa  52.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  28.8 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0925  hypothetical protein  37.14 
 
 		 86 aa  52.4  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0198354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.42 
 
 		 285 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  38.75 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.36 
 
 		 73 aa  51.6  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.07 
 
 		 74 aa  51.6  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.13 
 
 		 73 aa  51.2  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  36.99 
 
 		 73 aa  50.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1915  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.65 
 
 		 109 aa  50.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  36.62 
 
 		 103 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  35.44 
 
 		 74 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2353  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  29.9 
 
 		 108 aa  49.3  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130413  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  38.46 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.68 
 
 		 73 aa  49.3  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3663  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  28.12 
 
 		 148 aa  49.3  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.549056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  32.53 
 
 		 254 aa  48.9  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  31.2 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  34.85 
 
 		 74 aa  48.9  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  37.33 
 
 		 73 aa  48.5  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  24.74 
 
 		 108 aa  48.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>